Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gabpb2P81069 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gabpb2P81069 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gabpb2P81069 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gabpb2P81069 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gabpb2P81069 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gabpb2P81069 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gabpb2P81069 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gabpb2P81069 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gabpb2P81069 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gabpb2P81069 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gabpb2P81069 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gabpb2P81069 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gabpb2P81069 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gabpb2P81069 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gabpb2P81069 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gabpb2P81069 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gabpb2P81069 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gabpb2P81069 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gabpb2P81069 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gabpb2P81069 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gabpb2P81069 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gabpb2P81069 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gabpb2P81069 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gabpb2P81069 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gabpb2P81069 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gabpb2P81069 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gabpb2P81069 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gabpb2P81069 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gabpb2P81069 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gabpb2P81069 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Gabpb2P81069 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gabpb2P81069 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gabpb2P81069 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Gabpb2P81069 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gabpb2P81069 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gabpb2P81069 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gabpb2P81069 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gabpb2P81069 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gabpb2P81069 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gabpb2P81069 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gabpb2P81069 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gabpb2P81069 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gabpb2P81069 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gabpb2P81069 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gabpb2P81069 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gabpb2P81069 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gabpb2P81069 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gabpb2P81069 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gabpb2P81069 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gabpb2P81069 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gabpb2P81069 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gabpb2P81069 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gabpb2P81069 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gabpb2P81069 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gabpb2P81069 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gabpb2P81069 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gabpb2P81069 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gabpb2P81069 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gabpb2P81069 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gabpb2P81069 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Gabpb2P81069 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gabpb2P81069 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gabpb2P81069 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gabpb2P81069 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gabpb2P81069 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gabpb2P81069 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gabpb2P81069 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gabpb2P81069 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gabpb2P81069 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gabpb2P81069 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gabpb2P81069 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gabpb2P81069 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gabpb2P81069 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gabpb2P81069 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gabpb2P81069 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gabpb2P81069 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gabpb2P81069 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gabpb2P81069 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gabpb2P81069 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gabpb2P81069 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Gabpb2P81069 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gabpb2P81069 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gabpb2P81069 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gabpb2P81069 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gabpb2P81069 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gabpb2P81069 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gabpb2P81069 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gabpb2P81069 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gabpb2P81069 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gabpb2P81069 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gabpb2P81069 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gabpb2P81069 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gabpb2P81069 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gabpb2P81069 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gabpb2P81069 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gabpb2P81069 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gabpb2P81069 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gabpb2P81069 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gabpb2P81069 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms