Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx2P81066 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx2P81066 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx2P81066 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx2P81066 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx2P81066 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx2P81066 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx2P81066 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx2P81066 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx2P81066 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx2P81066 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx2P81066 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Irx2P81066 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Irx2P81066 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Irx2P81066 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Irx2P81066 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Irx2P81066 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Irx2P81066 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Irx2P81066 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Irx2P81066 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Irx2P81066 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Irx2P81066 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Irx2P81066 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Irx2P81066 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Irx2P81066 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irx2P81066 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irx2P81066 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irx2P81066 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irx2P81066 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irx2P81066 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irx2P81066 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irx2P81066 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irx2P81066 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irx2P81066 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irx2P81066 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irx2P81066 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Irx2P81066 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Irx2P81066 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Irx2P81066 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Irx2P81066 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Irx2P81066 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Irx2P81066 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Irx2P81066 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Irx2P81066 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Irx2P81066 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Irx2P81066 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Irx2P81066 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Irx2P81066 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irx2P81066 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irx2P81066 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irx2P81066 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irx2P81066 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irx2P81066 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irx2P81066 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irx2P81066 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irx2P81066 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irx2P81066 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irx2P81066 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irx2P81066 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irx2P81066 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irx2P81066 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irx2P81066 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irx2P81066 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irx2P81066 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irx2P81066 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irx2P81066 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irx2P81066 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irx2P81066 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irx2P81066 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irx2P81066 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irx2P81066 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irx2P81066 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irx2P81066 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irx2P81066 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irx2P81066 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irx2P81066 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irx2P81066 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irx2P81066 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irx2P81066 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Irx2P81066 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Irx2P81066 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Irx2P81066 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Irx2P81066 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Irx2P81066 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Irx2P81066 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Irx2P81066 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Irx2P81066 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Irx2P81066 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Irx2P81066 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Irx2P81066 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Irx2P81066 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Irx2P81066 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Irx2P81066 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Irx2P81066 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Irx2P81066 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Irx2P81066 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Irx2P81066 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Irx2P81066 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Irx2P81066 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Irx2P81066 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms