Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rad50P70388 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rad50P70388 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rad50P70388 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rad50P70388 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rad50P70388 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Rad50P70388 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rad50P70388 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rad50P70388 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rad50P70388 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rad50P70388 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rad50P70388 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rad50P70388 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rad50P70388 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rad50P70388 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rad50P70388 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rad50P70388 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rad50P70388 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Rad50P70388 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rad50P70388 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rad50P70388 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rad50P70388 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rad50P70388 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rad50P70388 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rad50P70388 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Rad50P70388 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rad50P70388 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rad50P70388 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rad50P70388 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rad50P70388 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rad50P70388 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rad50P70388 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rad50P70388 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rad50P70388 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rad50P70388 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rad50P70388 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rad50P70388 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rad50P70388 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rad50P70388 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rad50P70388 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rad50P70388 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rad50P70388 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rad50P70388 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rad50P70388 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rad50P70388 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rad50P70388 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Rad50P70388 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rad50P70388 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rad50P70388 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rad50P70388 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rad50P70388 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rad50P70388 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rad50P70388 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rad50P70388 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rad50P70388 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rad50P70388 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rad50P70388 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rad50P70388 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rad50P70388 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rad50P70388 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rad50P70388 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rad50P70388 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rad50P70388 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rad50P70388 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rad50P70388 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rad50P70388 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rad50P70388 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rad50P70388 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rad50P70388 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rad50P70388 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rad50P70388 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rad50P70388 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rad50P70388 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rad50P70388 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rad50P70388 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rad50P70388 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rad50P70388 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rad50P70388 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rad50P70388 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rad50P70388 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rad50P70388 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rad50P70388 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rad50P70388 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rad50P70388 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rad50P70388 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rad50P70388 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rad50P70388 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rad50P70388 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rad50P70388 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rad50P70388 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rad50P70388 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rad50P70388 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rad50P70388 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rad50P70388 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rad50P70388 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rad50P70388 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rad50P70388 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rad50P70388 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rad50P70388 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rad50P70388 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms