Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
Cux2P70298 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Cux2P70298 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Cux2P70298 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Cux2P70298 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Cux2P70298 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.53
Cux2P70298 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Cux2P70298 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Cux2P70298 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Cux2P70298 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Cux2P70298 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Cux2P70298 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Cux2P70298 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Cux2P70298 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Cux2P70298 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Cux2P70298 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Cux2P70298 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Cux2P70298 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Cux2P70298 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
Cux2P70298 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Cux2P70298 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Cux2P70298 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Cux2P70298 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Cux2P70298 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Cux2P70298 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Cux2P70298 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Cux2P70298 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Cux2P70298 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Cux2P70298 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Cux2P70298 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Cux2P70298 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
Cux2P70298 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Cux2P70298 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Cux2P70298 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Cux2P70298 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
Cux2P70298 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Cux2P70298 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Cux2P70298 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Cux2P70298 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Cux2P70298 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
Cux2P70298 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
Cux2P70298 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Cux2P70298 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
Cux2P70298 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Cux2P70298 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Cux2P70298 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Cux2P70298 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Cux2P70298 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Cux2P70298 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Cux2P70298 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Cux2P70298 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Cux2P70298 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Cux2P70298 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Cux2P70298 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Cux2P70298 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
Cux2P70298 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Cux2P70298 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Cux2P70298 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Cux2P70298 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Cux2P70298 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Cux2P70298 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Cux2P70298 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Cux2P70298 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Cux2P70298 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Cux2P70298 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Cux2P70298 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Cux2P70298 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Cux2P70298 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Cux2P70298 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Cux2P70298 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Cux2P70298 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Cux2P70298 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Cux2P70298 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Cux2P70298 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
Cux2P70298 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Cux2P70298 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Cux2P70298 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Cux2P70298 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Cux2P70298 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Cux2P70298 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Cux2P70298 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Cux2P70298 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Cux2P70298 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Cux2P70298 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Cux2P70298 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Cux2P70298 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Cux2P70298 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Cux2P70298 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Cux2P70298 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Cux2P70298 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Cux2P70298 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Cux2P70298 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
Cux2P70298 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
Cux2P70298 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Cux2P70298 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Cux2P70298 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Cux2P70298 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Cux2P70298 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Cux2P70298 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Cux2P70298 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms