Protein–RNA interactions for Protein: P70196

Traf6, TNF receptor-associated factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf6P70196 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Traf6P70196 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Traf6P70196 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Traf6P70196 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Traf6P70196 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Traf6P70196 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Traf6P70196 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf6P70196 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf6P70196 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf6P70196 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf6P70196 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf6P70196 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf6P70196 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf6P70196 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf6P70196 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf6P70196 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf6P70196 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf6P70196 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf6P70196 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf6P70196 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf6P70196 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf6P70196 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf6P70196 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf6P70196 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf6P70196 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf6P70196 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf6P70196 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf6P70196 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf6P70196 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Traf6P70196 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Traf6P70196 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Traf6P70196 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Traf6P70196 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Traf6P70196 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Traf6P70196 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Traf6P70196 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Traf6P70196 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Traf6P70196 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Traf6P70196 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Traf6P70196 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Traf6P70196 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Traf6P70196 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Traf6P70196 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Traf6P70196 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Traf6P70196 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf6P70196 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf6P70196 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf6P70196 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf6P70196 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf6P70196 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf6P70196 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf6P70196 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf6P70196 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf6P70196 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf6P70196 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf6P70196 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Traf6P70196 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Traf6P70196 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Traf6P70196 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Traf6P70196 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Traf6P70196 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Traf6P70196 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Traf6P70196 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Traf6P70196 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Traf6P70196 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Traf6P70196 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Traf6P70196 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Traf6P70196 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Traf6P70196 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Traf6P70196 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Traf6P70196 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Traf6P70196 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Traf6P70196 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Traf6P70196 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Traf6P70196 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Traf6P70196 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Traf6P70196 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Traf6P70196 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Traf6P70196 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Traf6P70196 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Traf6P70196 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Traf6P70196 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Traf6P70196 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Traf6P70196 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Traf6P70196 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Traf6P70196 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Traf6P70196 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Traf6P70196 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Traf6P70196 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Traf6P70196 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Traf6P70196 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Traf6P70196 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Traf6P70196 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Traf6P70196 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Traf6P70196 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Traf6P70196 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Traf6P70196 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Traf6P70196 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Traf6P70196 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Traf6P70196 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms