Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vsnl1P62761 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vsnl1P62761 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vsnl1P62761 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vsnl1P62761 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vsnl1P62761 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vsnl1P62761 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vsnl1P62761 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vsnl1P62761 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vsnl1P62761 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vsnl1P62761 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vsnl1P62761 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vsnl1P62761 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vsnl1P62761 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vsnl1P62761 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vsnl1P62761 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vsnl1P62761 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vsnl1P62761 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vsnl1P62761 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Vsnl1P62761 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vsnl1P62761 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vsnl1P62761 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vsnl1P62761 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vsnl1P62761 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vsnl1P62761 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vsnl1P62761 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vsnl1P62761 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vsnl1P62761 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vsnl1P62761 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vsnl1P62761 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vsnl1P62761 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vsnl1P62761 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vsnl1P62761 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vsnl1P62761 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vsnl1P62761 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vsnl1P62761 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vsnl1P62761 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vsnl1P62761 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vsnl1P62761 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vsnl1P62761 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vsnl1P62761 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vsnl1P62761 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vsnl1P62761 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vsnl1P62761 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vsnl1P62761 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vsnl1P62761 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vsnl1P62761 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vsnl1P62761 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vsnl1P62761 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vsnl1P62761 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vsnl1P62761 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vsnl1P62761 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vsnl1P62761 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vsnl1P62761 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vsnl1P62761 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vsnl1P62761 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vsnl1P62761 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Vsnl1P62761 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Vsnl1P62761 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Vsnl1P62761 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Vsnl1P62761 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Vsnl1P62761 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Vsnl1P62761 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Vsnl1P62761 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Vsnl1P62761 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Vsnl1P62761 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Vsnl1P62761 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Vsnl1P62761 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Vsnl1P62761 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Vsnl1P62761 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Vsnl1P62761 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Vsnl1P62761 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Vsnl1P62761 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Vsnl1P62761 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Vsnl1P62761 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Vsnl1P62761 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Vsnl1P62761 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Vsnl1P62761 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Vsnl1P62761 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Vsnl1P62761 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Vsnl1P62761 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Vsnl1P62761 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Vsnl1P62761 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Vsnl1P62761 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Vsnl1P62761 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Vsnl1P62761 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Vsnl1P62761 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Vsnl1P62761 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Vsnl1P62761 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Vsnl1P62761 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Vsnl1P62761 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Vsnl1P62761 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Vsnl1P62761 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Vsnl1P62761 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Vsnl1P62761 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Vsnl1P62761 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Vsnl1P62761 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Vsnl1P62761 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Vsnl1P62761 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Vsnl1P62761 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms