Protein–RNA interactions for Protein: P62322

Lsm5, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm5, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm5P62322 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms