Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmo4P61969 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmo4P61969 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmo4P61969 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmo4P61969 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmo4P61969 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmo4P61969 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmo4P61969 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmo4P61969 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmo4P61969 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmo4P61969 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmo4P61969 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmo4P61969 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmo4P61969 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmo4P61969 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmo4P61969 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmo4P61969 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmo4P61969 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmo4P61969 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmo4P61969 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmo4P61969 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmo4P61969 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmo4P61969 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmo4P61969 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmo4P61969 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmo4P61969 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmo4P61969 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmo4P61969 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmo4P61969 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmo4P61969 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmo4P61969 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmo4P61969 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmo4P61969 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmo4P61969 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Lmo4P61969 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lmo4P61969 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lmo4P61969 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lmo4P61969 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lmo4P61969 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lmo4P61969 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Lmo4P61969 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lmo4P61969 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lmo4P61969 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lmo4P61969 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lmo4P61969 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lmo4P61969 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lmo4P61969 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Lmo4P61969 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lmo4P61969 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lmo4P61969 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lmo4P61969 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lmo4P61969 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lmo4P61969 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lmo4P61969 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lmo4P61969 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lmo4P61969 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lmo4P61969 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lmo4P61969 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lmo4P61969 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmo4P61969 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lmo4P61969 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmo4P61969 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lmo4P61969 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lmo4P61969 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lmo4P61969 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmo4P61969 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmo4P61969 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Lmo4P61969 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmo4P61969 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmo4P61969 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmo4P61969 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmo4P61969 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lmo4P61969 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmo4P61969 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lmo4P61969 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lmo4P61969 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lmo4P61969 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmo4P61969 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Lmo4P61969 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Lmo4P61969 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lmo4P61969 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lmo4P61969 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lmo4P61969 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmo4P61969 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmo4P61969 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lmo4P61969 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmo4P61969 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmo4P61969 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmo4P61969 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmo4P61969 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmo4P61969 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmo4P61969 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lmo4P61969 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lmo4P61969 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lmo4P61969 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lmo4P61969 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lmo4P61969 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lmo4P61969 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lmo4P61969 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lmo4P61969 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms