Protein–RNA interactions for Protein: P61807

Snn, Stannin, mousemouse

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Length 88 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnnP61807 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SnnP61807 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SnnP61807 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SnnP61807 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SnnP61807 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SnnP61807 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SnnP61807 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SnnP61807 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SnnP61807 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SnnP61807 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SnnP61807 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SnnP61807 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SnnP61807 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SnnP61807 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SnnP61807 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SnnP61807 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SnnP61807 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SnnP61807 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SnnP61807 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SnnP61807 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SnnP61807 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SnnP61807 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SnnP61807 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SnnP61807 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SnnP61807 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SnnP61807 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SnnP61807 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SnnP61807 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SnnP61807 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SnnP61807 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SnnP61807 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SnnP61807 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SnnP61807 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SnnP61807 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SnnP61807 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SnnP61807 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SnnP61807 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SnnP61807 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SnnP61807 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SnnP61807 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SnnP61807 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SnnP61807 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SnnP61807 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SnnP61807 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SnnP61807 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SnnP61807 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SnnP61807 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SnnP61807 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SnnP61807 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SnnP61807 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SnnP61807 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SnnP61807 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SnnP61807 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
SnnP61807 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SnnP61807 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SnnP61807 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SnnP61807 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SnnP61807 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SnnP61807 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SnnP61807 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SnnP61807 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SnnP61807 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SnnP61807 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SnnP61807 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SnnP61807 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SnnP61807 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SnnP61807 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SnnP61807 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SnnP61807 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SnnP61807 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SnnP61807 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SnnP61807 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SnnP61807 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SnnP61807 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SnnP61807 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SnnP61807 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SnnP61807 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SnnP61807 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SnnP61807 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SnnP61807 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SnnP61807 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SnnP61807 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SnnP61807 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SnnP61807 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SnnP61807 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SnnP61807 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SnnP61807 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SnnP61807 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SnnP61807 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SnnP61807 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SnnP61807 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SnnP61807 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SnnP61807 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SnnP61807 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SnnP61807 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SnnP61807 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SnnP61807 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SnnP61807 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SnnP61807 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SnnP61807 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms