Protein–RNA interactions for Protein: P61588

Rnd3, Rho-related GTP-binding protein RhoE, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnd3P61588 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnd3P61588 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnd3P61588 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnd3P61588 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnd3P61588 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnd3P61588 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnd3P61588 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnd3P61588 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnd3P61588 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnd3P61588 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnd3P61588 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnd3P61588 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnd3P61588 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnd3P61588 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnd3P61588 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnd3P61588 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnd3P61588 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnd3P61588 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnd3P61588 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnd3P61588 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnd3P61588 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnd3P61588 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnd3P61588 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnd3P61588 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnd3P61588 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnd3P61588 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnd3P61588 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnd3P61588 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnd3P61588 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnd3P61588 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnd3P61588 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnd3P61588 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnd3P61588 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnd3P61588 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnd3P61588 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnd3P61588 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnd3P61588 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnd3P61588 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnd3P61588 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnd3P61588 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnd3P61588 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnd3P61588 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnd3P61588 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnd3P61588 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnd3P61588 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnd3P61588 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnd3P61588 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnd3P61588 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnd3P61588 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnd3P61588 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnd3P61588 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnd3P61588 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnd3P61588 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnd3P61588 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnd3P61588 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnd3P61588 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnd3P61588 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnd3P61588 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnd3P61588 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnd3P61588 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnd3P61588 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnd3P61588 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnd3P61588 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnd3P61588 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnd3P61588 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnd3P61588 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnd3P61588 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnd3P61588 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnd3P61588 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnd3P61588 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnd3P61588 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnd3P61588 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnd3P61588 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnd3P61588 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnd3P61588 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnd3P61588 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnd3P61588 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnd3P61588 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnd3P61588 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnd3P61588 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnd3P61588 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnd3P61588 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnd3P61588 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnd3P61588 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnd3P61588 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnd3P61588 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnd3P61588 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnd3P61588 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnd3P61588 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnd3P61588 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnd3P61588 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnd3P61588 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms