Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Smg6P61406 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Smg6P61406 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Smg6P61406 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Smg6P61406 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Smg6P61406 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Smg6P61406 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Smg6P61406 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Smg6P61406 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Smg6P61406 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Smg6P61406 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Smg6P61406 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Smg6P61406 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Smg6P61406 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Smg6P61406 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Smg6P61406 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Smg6P61406 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Smg6P61406 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Smg6P61406 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Smg6P61406 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Smg6P61406 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Smg6P61406 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Smg6P61406 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Smg6P61406 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Smg6P61406 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Smg6P61406 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Smg6P61406 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Smg6P61406 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Smg6P61406 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Smg6P61406 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Smg6P61406 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Smg6P61406 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Smg6P61406 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Smg6P61406 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Smg6P61406 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Smg6P61406 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Smg6P61406 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Smg6P61406 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Smg6P61406 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Smg6P61406 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Smg6P61406 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Smg6P61406 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smg6P61406 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smg6P61406 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smg6P61406 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smg6P61406 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smg6P61406 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smg6P61406 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smg6P61406 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smg6P61406 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smg6P61406 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smg6P61406 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Smg6P61406 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Smg6P61406 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Smg6P61406 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Smg6P61406 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Smg6P61406 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Smg6P61406 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Smg6P61406 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Smg6P61406 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Smg6P61406 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Smg6P61406 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Smg6P61406 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Smg6P61406 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Smg6P61406 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Smg6P61406 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Smg6P61406 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Smg6P61406 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Smg6P61406 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Smg6P61406 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Smg6P61406 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Smg6P61406 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Smg6P61406 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Smg6P61406 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Smg6P61406 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Smg6P61406 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smg6P61406 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smg6P61406 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smg6P61406 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smg6P61406 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smg6P61406 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smg6P61406 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Smg6P61406 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smg6P61406 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smg6P61406 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Smg6P61406 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Smg6P61406 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Smg6P61406 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Smg6P61406 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Smg6P61406 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Smg6P61406 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Smg6P61406 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Smg6P61406 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Smg6P61406 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Smg6P61406 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Smg6P61406 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smg6P61406 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smg6P61406 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smg6P61406 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smg6P61406 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms