Protein–RNA interactions for Protein: P61264

Stx1b, Syntaxin-1B, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1bP61264 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx1bP61264 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx1bP61264 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx1bP61264 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx1bP61264 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx1bP61264 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx1bP61264 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx1bP61264 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx1bP61264 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx1bP61264 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx1bP61264 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx1bP61264 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx1bP61264 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx1bP61264 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx1bP61264 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx1bP61264 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stx1bP61264 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stx1bP61264 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stx1bP61264 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stx1bP61264 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stx1bP61264 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stx1bP61264 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stx1bP61264 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stx1bP61264 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx1bP61264 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx1bP61264 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx1bP61264 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx1bP61264 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx1bP61264 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx1bP61264 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx1bP61264 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx1bP61264 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx1bP61264 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx1bP61264 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx1bP61264 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx1bP61264 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx1bP61264 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx1bP61264 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx1bP61264 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx1bP61264 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stx1bP61264 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stx1bP61264 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stx1bP61264 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stx1bP61264 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stx1bP61264 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stx1bP61264 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stx1bP61264 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stx1bP61264 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stx1bP61264 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stx1bP61264 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stx1bP61264 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stx1bP61264 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Stx1bP61264 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stx1bP61264 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stx1bP61264 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stx1bP61264 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stx1bP61264 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stx1bP61264 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stx1bP61264 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stx1bP61264 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stx1bP61264 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Stx1bP61264 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stx1bP61264 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stx1bP61264 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stx1bP61264 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stx1bP61264 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stx1bP61264 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stx1bP61264 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stx1bP61264 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stx1bP61264 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stx1bP61264 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stx1bP61264 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stx1bP61264 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stx1bP61264 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stx1bP61264 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stx1bP61264 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stx1bP61264 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stx1bP61264 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stx1bP61264 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stx1bP61264 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stx1bP61264 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stx1bP61264 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stx1bP61264 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stx1bP61264 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stx1bP61264 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stx1bP61264 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stx1bP61264 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stx1bP61264 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stx1bP61264 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stx1bP61264 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stx1bP61264 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stx1bP61264 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stx1bP61264 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Stx1bP61264 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stx1bP61264 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stx1bP61264 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stx1bP61264 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Stx1bP61264 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stx1bP61264 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stx1bP61264 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms