Protein–RNA interactions for Protein: P61166

Tmem258, Transmembrane protein 258, mousemouse

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem258P61166 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem258P61166 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms