Protein–RNA interactions for Protein: P59708

Sf3b6, Splicing factor 3B subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b6P59708 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3b6P59708 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3b6P59708 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3b6P59708 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3b6P59708 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3b6P59708 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3b6P59708 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3b6P59708 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3b6P59708 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b6P59708 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b6P59708 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b6P59708 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b6P59708 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b6P59708 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b6P59708 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b6P59708 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b6P59708 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b6P59708 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b6P59708 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b6P59708 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b6P59708 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b6P59708 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b6P59708 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b6P59708 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b6P59708 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b6P59708 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b6P59708 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b6P59708 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b6P59708 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b6P59708 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b6P59708 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b6P59708 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b6P59708 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b6P59708 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b6P59708 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b6P59708 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b6P59708 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b6P59708 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b6P59708 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b6P59708 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b6P59708 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b6P59708 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b6P59708 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b6P59708 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b6P59708 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b6P59708 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b6P59708 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b6P59708 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b6P59708 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b6P59708 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b6P59708 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b6P59708 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b6P59708 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b6P59708 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b6P59708 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b6P59708 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b6P59708 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b6P59708 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b6P59708 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b6P59708 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b6P59708 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b6P59708 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b6P59708 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b6P59708 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b6P59708 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b6P59708 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b6P59708 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b6P59708 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b6P59708 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b6P59708 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b6P59708 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b6P59708 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b6P59708 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b6P59708 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b6P59708 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b6P59708 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b6P59708 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b6P59708 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b6P59708 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b6P59708 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b6P59708 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b6P59708 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b6P59708 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b6P59708 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b6P59708 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b6P59708 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b6P59708 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b6P59708 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b6P59708 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b6P59708 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b6P59708 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b6P59708 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b6P59708 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b6P59708 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b6P59708 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b6P59708 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b6P59708 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b6P59708 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b6P59708 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b6P59708 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms