Protein–RNA interactions for Protein: P59242

Cgn, Cingulin, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CgnP59242 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CgnP59242 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CgnP59242 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CgnP59242 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CgnP59242 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CgnP59242 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CgnP59242 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CgnP59242 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CgnP59242 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CgnP59242 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CgnP59242 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CgnP59242 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CgnP59242 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CgnP59242 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CgnP59242 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CgnP59242 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CgnP59242 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CgnP59242 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CgnP59242 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CgnP59242 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CgnP59242 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CgnP59242 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CgnP59242 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CgnP59242 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CgnP59242 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CgnP59242 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CgnP59242 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CgnP59242 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CgnP59242 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CgnP59242 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CgnP59242 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CgnP59242 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CgnP59242 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CgnP59242 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CgnP59242 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CgnP59242 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CgnP59242 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CgnP59242 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CgnP59242 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CgnP59242 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CgnP59242 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CgnP59242 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CgnP59242 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CgnP59242 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CgnP59242 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CgnP59242 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CgnP59242 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CgnP59242 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CgnP59242 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CgnP59242 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CgnP59242 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CgnP59242 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CgnP59242 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CgnP59242 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CgnP59242 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CgnP59242 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CgnP59242 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CgnP59242 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CgnP59242 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CgnP59242 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CgnP59242 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CgnP59242 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CgnP59242 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CgnP59242 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CgnP59242 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CgnP59242 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CgnP59242 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CgnP59242 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CgnP59242 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CgnP59242 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CgnP59242 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CgnP59242 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CgnP59242 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CgnP59242 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CgnP59242 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CgnP59242 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CgnP59242 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CgnP59242 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CgnP59242 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CgnP59242 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CgnP59242 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CgnP59242 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CgnP59242 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CgnP59242 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CgnP59242 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CgnP59242 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CgnP59242 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CgnP59242 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CgnP59242 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CgnP59242 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CgnP59242 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CgnP59242 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CgnP59242 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CgnP59242 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CgnP59242 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CgnP59242 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CgnP59242 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CgnP59242 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CgnP59242 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CgnP59242 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms