Protein–RNA interactions for Protein: P59054

Csrnp1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp1P59054 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Csrnp1P59054 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Csrnp1P59054 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Csrnp1P59054 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Csrnp1P59054 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Csrnp1P59054 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Csrnp1P59054 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Csrnp1P59054 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Csrnp1P59054 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Csrnp1P59054 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Csrnp1P59054 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Csrnp1P59054 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Csrnp1P59054 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Csrnp1P59054 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Csrnp1P59054 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Csrnp1P59054 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Csrnp1P59054 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Csrnp1P59054 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Csrnp1P59054 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Csrnp1P59054 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Csrnp1P59054 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Csrnp1P59054 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Csrnp1P59054 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Csrnp1P59054 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Csrnp1P59054 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Csrnp1P59054 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Csrnp1P59054 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Csrnp1P59054 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Csrnp1P59054 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Csrnp1P59054 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Csrnp1P59054 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Csrnp1P59054 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Csrnp1P59054 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Csrnp1P59054 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Csrnp1P59054 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Csrnp1P59054 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Csrnp1P59054 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Csrnp1P59054 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Csrnp1P59054 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Csrnp1P59054 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Csrnp1P59054 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Csrnp1P59054 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Csrnp1P59054 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Csrnp1P59054 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Csrnp1P59054 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Csrnp1P59054 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Csrnp1P59054 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Csrnp1P59054 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Csrnp1P59054 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Csrnp1P59054 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Csrnp1P59054 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Csrnp1P59054 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Csrnp1P59054 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Csrnp1P59054 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Csrnp1P59054 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Csrnp1P59054 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Csrnp1P59054 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Csrnp1P59054 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Csrnp1P59054 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Csrnp1P59054 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Csrnp1P59054 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Csrnp1P59054 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Csrnp1P59054 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Csrnp1P59054 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Csrnp1P59054 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Csrnp1P59054 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Csrnp1P59054 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Csrnp1P59054 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Csrnp1P59054 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Csrnp1P59054 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Csrnp1P59054 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Csrnp1P59054 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Csrnp1P59054 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Csrnp1P59054 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Csrnp1P59054 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Csrnp1P59054 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Csrnp1P59054 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Csrnp1P59054 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Csrnp1P59054 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Csrnp1P59054 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Csrnp1P59054 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Csrnp1P59054 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Csrnp1P59054 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Csrnp1P59054 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Csrnp1P59054 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Csrnp1P59054 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Csrnp1P59054 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Csrnp1P59054 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Csrnp1P59054 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Csrnp1P59054 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Csrnp1P59054 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Csrnp1P59054 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Csrnp1P59054 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Csrnp1P59054 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Csrnp1P59054 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Csrnp1P59054 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Csrnp1P59054 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Csrnp1P59054 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Csrnp1P59054 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Csrnp1P59054 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms