Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rhbdl3P58873 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rhbdl3P58873 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rhbdl3P58873 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rhbdl3P58873 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rhbdl3P58873 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rhbdl3P58873 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rhbdl3P58873 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rhbdl3P58873 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rhbdl3P58873 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rhbdl3P58873 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Rhbdl3P58873 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rhbdl3P58873 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rhbdl3P58873 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rhbdl3P58873 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rhbdl3P58873 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rhbdl3P58873 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rhbdl3P58873 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rhbdl3P58873 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rhbdl3P58873 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rhbdl3P58873 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rhbdl3P58873 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rhbdl3P58873 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rhbdl3P58873 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rhbdl3P58873 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rhbdl3P58873 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rhbdl3P58873 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rhbdl3P58873 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rhbdl3P58873 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rhbdl3P58873 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rhbdl3P58873 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rhbdl3P58873 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rhbdl3P58873 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rhbdl3P58873 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rhbdl3P58873 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rhbdl3P58873 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rhbdl3P58873 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rhbdl3P58873 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rhbdl3P58873 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rhbdl3P58873 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rhbdl3P58873 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rhbdl3P58873 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rhbdl3P58873 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rhbdl3P58873 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rhbdl3P58873 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rhbdl3P58873 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rhbdl3P58873 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rhbdl3P58873 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rhbdl3P58873 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rhbdl3P58873 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rhbdl3P58873 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rhbdl3P58873 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rhbdl3P58873 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rhbdl3P58873 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rhbdl3P58873 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rhbdl3P58873 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rhbdl3P58873 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rhbdl3P58873 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rhbdl3P58873 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rhbdl3P58873 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rhbdl3P58873 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rhbdl3P58873 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rhbdl3P58873 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rhbdl3P58873 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rhbdl3P58873 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rhbdl3P58873 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rhbdl3P58873 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rhbdl3P58873 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rhbdl3P58873 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rhbdl3P58873 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rhbdl3P58873 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rhbdl3P58873 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rhbdl3P58873 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rhbdl3P58873 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rhbdl3P58873 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rhbdl3P58873 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rhbdl3P58873 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rhbdl3P58873 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rhbdl3P58873 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rhbdl3P58873 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rhbdl3P58873 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rhbdl3P58873 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rhbdl3P58873 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rhbdl3P58873 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rhbdl3P58873 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rhbdl3P58873 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rhbdl3P58873 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rhbdl3P58873 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rhbdl3P58873 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rhbdl3P58873 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rhbdl3P58873 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rhbdl3P58873 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rhbdl3P58873 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rhbdl3P58873 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rhbdl3P58873 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rhbdl3P58873 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rhbdl3P58873 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rhbdl3P58873 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rhbdl3P58873 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rhbdl3P58873 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms