Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Paxbp1P58501 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Paxbp1P58501 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Paxbp1P58501 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Paxbp1P58501 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Paxbp1P58501 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Paxbp1P58501 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Paxbp1P58501 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Paxbp1P58501 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Paxbp1P58501 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Paxbp1P58501 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Paxbp1P58501 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Paxbp1P58501 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Paxbp1P58501 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Paxbp1P58501 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Paxbp1P58501 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Paxbp1P58501 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Paxbp1P58501 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Paxbp1P58501 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Paxbp1P58501 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Paxbp1P58501 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Paxbp1P58501 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Paxbp1P58501 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Paxbp1P58501 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Paxbp1P58501 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Paxbp1P58501 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Paxbp1P58501 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Paxbp1P58501 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Paxbp1P58501 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Paxbp1P58501 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Paxbp1P58501 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Paxbp1P58501 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Paxbp1P58501 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Paxbp1P58501 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Paxbp1P58501 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Paxbp1P58501 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Paxbp1P58501 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Paxbp1P58501 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Paxbp1P58501 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Paxbp1P58501 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Paxbp1P58501 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Paxbp1P58501 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Paxbp1P58501 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Paxbp1P58501 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Paxbp1P58501 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Paxbp1P58501 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Paxbp1P58501 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Paxbp1P58501 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Paxbp1P58501 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Paxbp1P58501 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Paxbp1P58501 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Paxbp1P58501 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Paxbp1P58501 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Paxbp1P58501 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Paxbp1P58501 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Paxbp1P58501 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Paxbp1P58501 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Paxbp1P58501 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Paxbp1P58501 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Paxbp1P58501 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Paxbp1P58501 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Paxbp1P58501 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Paxbp1P58501 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Paxbp1P58501 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Paxbp1P58501 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Paxbp1P58501 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Paxbp1P58501 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Paxbp1P58501 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Paxbp1P58501 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Paxbp1P58501 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Paxbp1P58501 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Paxbp1P58501 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Paxbp1P58501 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Paxbp1P58501 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Paxbp1P58501 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Paxbp1P58501 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Paxbp1P58501 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Paxbp1P58501 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Paxbp1P58501 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Paxbp1P58501 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Paxbp1P58501 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Paxbp1P58501 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Paxbp1P58501 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Paxbp1P58501 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Paxbp1P58501 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Paxbp1P58501 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Paxbp1P58501 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Paxbp1P58501 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Paxbp1P58501 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Paxbp1P58501 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Paxbp1P58501 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Paxbp1P58501 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Paxbp1P58501 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Paxbp1P58501 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Paxbp1P58501 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Paxbp1P58501 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Paxbp1P58501 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Paxbp1P58501 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Paxbp1P58501 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Paxbp1P58501 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms