Protein–RNA interactions for Protein: P58404

Strn4, Striatin-4, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strn4P58404 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Strn4P58404 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Strn4P58404 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Strn4P58404 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Strn4P58404 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Strn4P58404 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Strn4P58404 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Strn4P58404 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Strn4P58404 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Strn4P58404 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Strn4P58404 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Strn4P58404 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Strn4P58404 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Strn4P58404 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Strn4P58404 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Strn4P58404 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Strn4P58404 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Strn4P58404 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Strn4P58404 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Strn4P58404 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Strn4P58404 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Strn4P58404 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Strn4P58404 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Strn4P58404 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Strn4P58404 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Strn4P58404 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Strn4P58404 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Strn4P58404 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Strn4P58404 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Strn4P58404 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Strn4P58404 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Strn4P58404 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Strn4P58404 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Strn4P58404 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Strn4P58404 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Strn4P58404 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Strn4P58404 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Strn4P58404 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Strn4P58404 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Strn4P58404 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Strn4P58404 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Strn4P58404 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Strn4P58404 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Strn4P58404 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Strn4P58404 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Strn4P58404 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Strn4P58404 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Strn4P58404 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Strn4P58404 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Strn4P58404 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Strn4P58404 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Strn4P58404 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Strn4P58404 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Strn4P58404 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Strn4P58404 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Strn4P58404 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Strn4P58404 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Strn4P58404 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Strn4P58404 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Strn4P58404 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Strn4P58404 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Strn4P58404 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Strn4P58404 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Strn4P58404 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Strn4P58404 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Strn4P58404 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Strn4P58404 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Strn4P58404 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Strn4P58404 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Strn4P58404 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Strn4P58404 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Strn4P58404 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Strn4P58404 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Strn4P58404 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Strn4P58404 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Strn4P58404 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Strn4P58404 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Strn4P58404 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Strn4P58404 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Strn4P58404 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Strn4P58404 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Strn4P58404 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Strn4P58404 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Strn4P58404 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Strn4P58404 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Strn4P58404 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Strn4P58404 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Strn4P58404 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Strn4P58404 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Strn4P58404 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Strn4P58404 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Strn4P58404 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Strn4P58404 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Strn4P58404 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Strn4P58404 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Strn4P58404 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Strn4P58404 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Strn4P58404 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Strn4P58404 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Strn4P58404 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms