Protein–RNA interactions for Protein: P57784

Snrpa1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpa1P57784 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snrpa1P57784 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snrpa1P57784 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snrpa1P57784 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snrpa1P57784 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snrpa1P57784 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snrpa1P57784 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snrpa1P57784 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snrpa1P57784 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snrpa1P57784 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snrpa1P57784 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snrpa1P57784 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Snrpa1P57784 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snrpa1P57784 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snrpa1P57784 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snrpa1P57784 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snrpa1P57784 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snrpa1P57784 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snrpa1P57784 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snrpa1P57784 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snrpa1P57784 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snrpa1P57784 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snrpa1P57784 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Snrpa1P57784 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snrpa1P57784 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snrpa1P57784 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snrpa1P57784 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snrpa1P57784 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snrpa1P57784 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snrpa1P57784 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snrpa1P57784 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Snrpa1P57784 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snrpa1P57784 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snrpa1P57784 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snrpa1P57784 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snrpa1P57784 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snrpa1P57784 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snrpa1P57784 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snrpa1P57784 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snrpa1P57784 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snrpa1P57784 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snrpa1P57784 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Snrpa1P57784 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snrpa1P57784 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snrpa1P57784 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snrpa1P57784 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snrpa1P57784 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snrpa1P57784 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snrpa1P57784 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snrpa1P57784 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snrpa1P57784 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snrpa1P57784 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snrpa1P57784 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snrpa1P57784 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snrpa1P57784 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snrpa1P57784 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snrpa1P57784 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snrpa1P57784 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Snrpa1P57784 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Snrpa1P57784 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snrpa1P57784 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Snrpa1P57784 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snrpa1P57784 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snrpa1P57784 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snrpa1P57784 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snrpa1P57784 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Snrpa1P57784 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snrpa1P57784 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snrpa1P57784 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snrpa1P57784 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snrpa1P57784 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snrpa1P57784 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snrpa1P57784 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Snrpa1P57784 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Snrpa1P57784 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snrpa1P57784 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snrpa1P57784 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snrpa1P57784 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snrpa1P57784 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snrpa1P57784 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snrpa1P57784 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snrpa1P57784 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snrpa1P57784 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snrpa1P57784 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snrpa1P57784 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snrpa1P57784 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snrpa1P57784 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Snrpa1P57784 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snrpa1P57784 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snrpa1P57784 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snrpa1P57784 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snrpa1P57784 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Snrpa1P57784 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snrpa1P57784 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snrpa1P57784 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snrpa1P57784 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snrpa1P57784 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snrpa1P57784 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Snrpa1P57784 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snrpa1P57784 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms