Protein–RNA interactions for Protein: P56528

Cd38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd38P56528 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd38P56528 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd38P56528 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd38P56528 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd38P56528 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd38P56528 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd38P56528 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd38P56528 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd38P56528 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd38P56528 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd38P56528 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd38P56528 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd38P56528 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd38P56528 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd38P56528 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd38P56528 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd38P56528 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd38P56528 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd38P56528 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd38P56528 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd38P56528 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd38P56528 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd38P56528 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd38P56528 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd38P56528 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd38P56528 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd38P56528 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd38P56528 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd38P56528 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd38P56528 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd38P56528 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd38P56528 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd38P56528 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd38P56528 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd38P56528 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd38P56528 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd38P56528 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd38P56528 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd38P56528 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd38P56528 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd38P56528 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd38P56528 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd38P56528 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd38P56528 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd38P56528 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd38P56528 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd38P56528 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd38P56528 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd38P56528 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cd38P56528 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cd38P56528 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cd38P56528 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cd38P56528 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cd38P56528 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cd38P56528 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cd38P56528 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cd38P56528 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cd38P56528 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd38P56528 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd38P56528 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd38P56528 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd38P56528 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd38P56528 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd38P56528 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd38P56528 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd38P56528 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd38P56528 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd38P56528 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd38P56528 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd38P56528 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd38P56528 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd38P56528 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd38P56528 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd38P56528 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd38P56528 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd38P56528 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd38P56528 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd38P56528 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd38P56528 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd38P56528 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd38P56528 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd38P56528 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd38P56528 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd38P56528 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd38P56528 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd38P56528 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd38P56528 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd38P56528 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd38P56528 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd38P56528 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd38P56528 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd38P56528 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd38P56528 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd38P56528 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd38P56528 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd38P56528 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd38P56528 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd38P56528 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd38P56528 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd38P56528 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms