Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Irf5P56477 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Irf5P56477 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Irf5P56477 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Irf5P56477 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Irf5P56477 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Irf5P56477 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Irf5P56477 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Irf5P56477 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Irf5P56477 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Irf5P56477 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Irf5P56477 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Irf5P56477 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Irf5P56477 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Irf5P56477 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Irf5P56477 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Irf5P56477 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Irf5P56477 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Irf5P56477 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Irf5P56477 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Irf5P56477 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Irf5P56477 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Irf5P56477 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irf5P56477 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irf5P56477 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irf5P56477 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irf5P56477 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irf5P56477 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irf5P56477 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irf5P56477 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irf5P56477 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irf5P56477 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irf5P56477 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Irf5P56477 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Irf5P56477 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Irf5P56477 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Irf5P56477 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Irf5P56477 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Irf5P56477 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Irf5P56477 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Irf5P56477 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Irf5P56477 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Irf5P56477 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Irf5P56477 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Irf5P56477 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Irf5P56477 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Irf5P56477 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Irf5P56477 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Irf5P56477 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Irf5P56477 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Irf5P56477 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Irf5P56477 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Irf5P56477 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Irf5P56477 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Irf5P56477 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Irf5P56477 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Irf5P56477 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Irf5P56477 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Irf5P56477 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Irf5P56477 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Irf5P56477 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Irf5P56477 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Irf5P56477 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Irf5P56477 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Irf5P56477 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Irf5P56477 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Irf5P56477 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Irf5P56477 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Irf5P56477 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Irf5P56477 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Irf5P56477 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Irf5P56477 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irf5P56477 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irf5P56477 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Irf5P56477 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irf5P56477 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irf5P56477 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irf5P56477 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Irf5P56477 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irf5P56477 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irf5P56477 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Irf5P56477 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Irf5P56477 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Irf5P56477 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Irf5P56477 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Irf5P56477 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Irf5P56477 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Irf5P56477 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Irf5P56477 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Irf5P56477 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Irf5P56477 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Irf5P56477 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Irf5P56477 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Irf5P56477 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Irf5P56477 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Irf5P56477 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Irf5P56477 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Irf5P56477 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Irf5P56477 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Irf5P56477 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms