Protein–RNA interactions for Protein: P56371

Rab4a, Ras-related protein Rab-4A, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab4aP56371 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab4aP56371 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab4aP56371 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab4aP56371 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab4aP56371 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab4aP56371 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab4aP56371 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab4aP56371 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab4aP56371 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab4aP56371 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab4aP56371 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab4aP56371 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab4aP56371 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab4aP56371 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab4aP56371 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab4aP56371 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab4aP56371 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab4aP56371 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab4aP56371 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab4aP56371 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab4aP56371 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab4aP56371 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab4aP56371 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab4aP56371 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab4aP56371 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab4aP56371 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab4aP56371 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab4aP56371 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab4aP56371 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab4aP56371 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab4aP56371 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab4aP56371 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab4aP56371 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab4aP56371 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab4aP56371 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab4aP56371 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab4aP56371 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab4aP56371 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab4aP56371 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab4aP56371 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab4aP56371 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab4aP56371 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab4aP56371 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab4aP56371 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab4aP56371 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab4aP56371 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab4aP56371 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab4aP56371 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab4aP56371 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab4aP56371 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab4aP56371 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab4aP56371 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab4aP56371 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab4aP56371 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab4aP56371 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab4aP56371 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab4aP56371 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab4aP56371 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab4aP56371 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab4aP56371 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab4aP56371 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab4aP56371 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab4aP56371 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab4aP56371 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab4aP56371 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab4aP56371 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab4aP56371 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab4aP56371 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab4aP56371 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab4aP56371 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab4aP56371 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab4aP56371 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab4aP56371 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab4aP56371 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab4aP56371 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab4aP56371 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab4aP56371 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab4aP56371 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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