Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cacnb3P54285 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cacnb3P54285 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cacnb3P54285 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Cacnb3P54285 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cacnb3P54285 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cacnb3P54285 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cacnb3P54285 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cacnb3P54285 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cacnb3P54285 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cacnb3P54285 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cacnb3P54285 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cacnb3P54285 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cacnb3P54285 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cacnb3P54285 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cacnb3P54285 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cacnb3P54285 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Cacnb3P54285 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cacnb3P54285 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cacnb3P54285 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cacnb3P54285 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cacnb3P54285 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cacnb3P54285 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cacnb3P54285 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cacnb3P54285 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cacnb3P54285 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Cacnb3P54285 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cacnb3P54285 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cacnb3P54285 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cacnb3P54285 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cacnb3P54285 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cacnb3P54285 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Cacnb3P54285 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cacnb3P54285 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cacnb3P54285 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cacnb3P54285 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cacnb3P54285 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cacnb3P54285 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cacnb3P54285 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cacnb3P54285 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cacnb3P54285 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cacnb3P54285 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cacnb3P54285 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cacnb3P54285 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cacnb3P54285 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cacnb3P54285 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cacnb3P54285 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cacnb3P54285 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cacnb3P54285 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cacnb3P54285 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cacnb3P54285 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cacnb3P54285 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cacnb3P54285 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cacnb3P54285 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cacnb3P54285 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cacnb3P54285 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cacnb3P54285 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cacnb3P54285 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Cacnb3P54285 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cacnb3P54285 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cacnb3P54285 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cacnb3P54285 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cacnb3P54285 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cacnb3P54285 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cacnb3P54285 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cacnb3P54285 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cacnb3P54285 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cacnb3P54285 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cacnb3P54285 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cacnb3P54285 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cacnb3P54285 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cacnb3P54285 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cacnb3P54285 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cacnb3P54285 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cacnb3P54285 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cacnb3P54285 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cacnb3P54285 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Cacnb3P54285 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cacnb3P54285 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cacnb3P54285 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Cacnb3P54285 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cacnb3P54285 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cacnb3P54285 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cacnb3P54285 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cacnb3P54285 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cacnb3P54285 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cacnb3P54285 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cacnb3P54285 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cacnb3P54285 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cacnb3P54285 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cacnb3P54285 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cacnb3P54285 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cacnb3P54285 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cacnb3P54285 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cacnb3P54285 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cacnb3P54285 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cacnb3P54285 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cacnb3P54285 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cacnb3P54285 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cacnb3P54285 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms