Protein–RNA interactions for Protein: P53657

Pklr, Pyruvate kinase PKLR, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PklrP53657 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PklrP53657 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PklrP53657 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PklrP53657 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PklrP53657 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PklrP53657 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PklrP53657 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PklrP53657 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PklrP53657 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PklrP53657 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PklrP53657 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PklrP53657 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PklrP53657 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PklrP53657 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PklrP53657 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PklrP53657 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PklrP53657 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PklrP53657 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PklrP53657 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PklrP53657 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PklrP53657 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PklrP53657 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PklrP53657 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PklrP53657 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PklrP53657 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PklrP53657 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PklrP53657 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PklrP53657 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PklrP53657 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PklrP53657 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PklrP53657 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PklrP53657 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PklrP53657 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PklrP53657 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PklrP53657 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PklrP53657 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PklrP53657 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PklrP53657 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PklrP53657 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PklrP53657 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PklrP53657 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PklrP53657 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PklrP53657 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PklrP53657 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PklrP53657 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PklrP53657 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PklrP53657 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PklrP53657 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PklrP53657 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PklrP53657 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PklrP53657 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PklrP53657 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PklrP53657 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PklrP53657 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PklrP53657 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PklrP53657 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PklrP53657 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PklrP53657 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PklrP53657 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PklrP53657 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PklrP53657 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PklrP53657 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PklrP53657 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PklrP53657 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PklrP53657 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PklrP53657 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PklrP53657 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PklrP53657 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PklrP53657 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PklrP53657 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PklrP53657 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PklrP53657 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PklrP53657 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PklrP53657 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PklrP53657 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PklrP53657 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PklrP53657 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PklrP53657 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PklrP53657 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PklrP53657 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PklrP53657 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PklrP53657 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PklrP53657 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PklrP53657 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PklrP53657 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PklrP53657 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PklrP53657 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PklrP53657 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PklrP53657 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PklrP53657 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PklrP53657 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PklrP53657 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PklrP53657 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PklrP53657 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PklrP53657 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PklrP53657 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PklrP53657 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PklrP53657 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PklrP53657 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PklrP53657 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms