Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fgd1P52734 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fgd1P52734 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fgd1P52734 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fgd1P52734 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fgd1P52734 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fgd1P52734 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fgd1P52734 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fgd1P52734 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fgd1P52734 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Fgd1P52734 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fgd1P52734 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fgd1P52734 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fgd1P52734 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fgd1P52734 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fgd1P52734 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fgd1P52734 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fgd1P52734 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fgd1P52734 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fgd1P52734 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fgd1P52734 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fgd1P52734 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fgd1P52734 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fgd1P52734 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fgd1P52734 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fgd1P52734 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fgd1P52734 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fgd1P52734 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fgd1P52734 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fgd1P52734 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fgd1P52734 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fgd1P52734 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fgd1P52734 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Fgd1P52734 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fgd1P52734 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Fgd1P52734 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fgd1P52734 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fgd1P52734 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fgd1P52734 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fgd1P52734 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fgd1P52734 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fgd1P52734 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fgd1P52734 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fgd1P52734 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fgd1P52734 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fgd1P52734 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fgd1P52734 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fgd1P52734 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fgd1P52734 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fgd1P52734 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fgd1P52734 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fgd1P52734 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fgd1P52734 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fgd1P52734 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fgd1P52734 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fgd1P52734 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fgd1P52734 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fgd1P52734 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fgd1P52734 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fgd1P52734 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fgd1P52734 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fgd1P52734 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fgd1P52734 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fgd1P52734 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fgd1P52734 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Fgd1P52734 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fgd1P52734 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fgd1P52734 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fgd1P52734 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fgd1P52734 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fgd1P52734 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fgd1P52734 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fgd1P52734 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fgd1P52734 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fgd1P52734 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fgd1P52734 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fgd1P52734 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fgd1P52734 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fgd1P52734 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fgd1P52734 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fgd1P52734 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fgd1P52734 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Fgd1P52734 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fgd1P52734 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fgd1P52734 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fgd1P52734 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fgd1P52734 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fgd1P52734 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fgd1P52734 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fgd1P52734 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fgd1P52734 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fgd1P52734 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fgd1P52734 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fgd1P52734 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fgd1P52734 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fgd1P52734 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fgd1P52734 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Fgd1P52734 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fgd1P52734 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fgd1P52734 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms