Protein–RNA interactions for Protein: P52431

Pold1, DNA polymerase delta catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pold1P52431 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pold1P52431 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Pold1P52431 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pold1P52431 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pold1P52431 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pold1P52431 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pold1P52431 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pold1P52431 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pold1P52431 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pold1P52431 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pold1P52431 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pold1P52431 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pold1P52431 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pold1P52431 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pold1P52431 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pold1P52431 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pold1P52431 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pold1P52431 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pold1P52431 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pold1P52431 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pold1P52431 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pold1P52431 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pold1P52431 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pold1P52431 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pold1P52431 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pold1P52431 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pold1P52431 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pold1P52431 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pold1P52431 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pold1P52431 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pold1P52431 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pold1P52431 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pold1P52431 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pold1P52431 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pold1P52431 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pold1P52431 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pold1P52431 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pold1P52431 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pold1P52431 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pold1P52431 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pold1P52431 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pold1P52431 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pold1P52431 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pold1P52431 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pold1P52431 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pold1P52431 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pold1P52431 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pold1P52431 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pold1P52431 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pold1P52431 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pold1P52431 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pold1P52431 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pold1P52431 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pold1P52431 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pold1P52431 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pold1P52431 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pold1P52431 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pold1P52431 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pold1P52431 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pold1P52431 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pold1P52431 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pold1P52431 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pold1P52431 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pold1P52431 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pold1P52431 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pold1P52431 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pold1P52431 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pold1P52431 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pold1P52431 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Pold1P52431 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pold1P52431 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pold1P52431 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Pold1P52431 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pold1P52431 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pold1P52431 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pold1P52431 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pold1P52431 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pold1P52431 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pold1P52431 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pold1P52431 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pold1P52431 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pold1P52431 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pold1P52431 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pold1P52431 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pold1P52431 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Pold1P52431 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pold1P52431 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pold1P52431 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pold1P52431 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pold1P52431 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pold1P52431 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pold1P52431 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pold1P52431 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pold1P52431 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pold1P52431 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pold1P52431 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pold1P52431 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pold1P52431 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pold1P52431 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pold1P52431 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms