Protein–RNA interactions for Protein: P51682

Ccr5, C-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr5P51682 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccr5P51682 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccr5P51682 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccr5P51682 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccr5P51682 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccr5P51682 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccr5P51682 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccr5P51682 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccr5P51682 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccr5P51682 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccr5P51682 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccr5P51682 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccr5P51682 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccr5P51682 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccr5P51682 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccr5P51682 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccr5P51682 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccr5P51682 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccr5P51682 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccr5P51682 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccr5P51682 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccr5P51682 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccr5P51682 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccr5P51682 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccr5P51682 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccr5P51682 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccr5P51682 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccr5P51682 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccr5P51682 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccr5P51682 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccr5P51682 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccr5P51682 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccr5P51682 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccr5P51682 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccr5P51682 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccr5P51682 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccr5P51682 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccr5P51682 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccr5P51682 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccr5P51682 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccr5P51682 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccr5P51682 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccr5P51682 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccr5P51682 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccr5P51682 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccr5P51682 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccr5P51682 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccr5P51682 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccr5P51682 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccr5P51682 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccr5P51682 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ccr5P51682 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccr5P51682 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccr5P51682 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccr5P51682 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccr5P51682 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccr5P51682 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccr5P51682 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccr5P51682 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccr5P51682 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccr5P51682 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccr5P51682 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccr5P51682 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccr5P51682 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccr5P51682 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccr5P51682 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccr5P51682 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccr5P51682 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccr5P51682 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccr5P51682 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccr5P51682 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccr5P51682 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccr5P51682 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccr5P51682 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccr5P51682 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccr5P51682 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccr5P51682 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccr5P51682 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccr5P51682 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccr5P51682 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccr5P51682 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccr5P51682 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccr5P51682 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccr5P51682 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccr5P51682 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccr5P51682 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccr5P51682 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccr5P51682 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccr5P51682 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccr5P51682 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccr5P51682 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccr5P51682 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccr5P51682 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccr5P51682 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccr5P51682 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccr5P51682 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccr5P51682 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccr5P51682 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccr5P51682 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccr5P51682 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms