Protein–RNA interactions for Protein: P51642

Cntf, Ciliary neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfP51642 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CntfP51642 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CntfP51642 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CntfP51642 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CntfP51642 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CntfP51642 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CntfP51642 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CntfP51642 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CntfP51642 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CntfP51642 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CntfP51642 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CntfP51642 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CntfP51642 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CntfP51642 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CntfP51642 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CntfP51642 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CntfP51642 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CntfP51642 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CntfP51642 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CntfP51642 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CntfP51642 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CntfP51642 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CntfP51642 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CntfP51642 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CntfP51642 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CntfP51642 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CntfP51642 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CntfP51642 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CntfP51642 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CntfP51642 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CntfP51642 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CntfP51642 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CntfP51642 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CntfP51642 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CntfP51642 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CntfP51642 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CntfP51642 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CntfP51642 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CntfP51642 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CntfP51642 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CntfP51642 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CntfP51642 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CntfP51642 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CntfP51642 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CntfP51642 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CntfP51642 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CntfP51642 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CntfP51642 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CntfP51642 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CntfP51642 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CntfP51642 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CntfP51642 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CntfP51642 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CntfP51642 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CntfP51642 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CntfP51642 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CntfP51642 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CntfP51642 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CntfP51642 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CntfP51642 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CntfP51642 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CntfP51642 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CntfP51642 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CntfP51642 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CntfP51642 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CntfP51642 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CntfP51642 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CntfP51642 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CntfP51642 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CntfP51642 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CntfP51642 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CntfP51642 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CntfP51642 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CntfP51642 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CntfP51642 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CntfP51642 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CntfP51642 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CntfP51642 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CntfP51642 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CntfP51642 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CntfP51642 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CntfP51642 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CntfP51642 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CntfP51642 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CntfP51642 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CntfP51642 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CntfP51642 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CntfP51642 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CntfP51642 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CntfP51642 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CntfP51642 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CntfP51642 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CntfP51642 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CntfP51642 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CntfP51642 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CntfP51642 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CntfP51642 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CntfP51642 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CntfP51642 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CntfP51642 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms