Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TspoP50637 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TspoP50637 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TspoP50637 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TspoP50637 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TspoP50637 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TspoP50637 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TspoP50637 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TspoP50637 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TspoP50637 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TspoP50637 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TspoP50637 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TspoP50637 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TspoP50637 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TspoP50637 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TspoP50637 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TspoP50637 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TspoP50637 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TspoP50637 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TspoP50637 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TspoP50637 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TspoP50637 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TspoP50637 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TspoP50637 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TspoP50637 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TspoP50637 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TspoP50637 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TspoP50637 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TspoP50637 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TspoP50637 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TspoP50637 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TspoP50637 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TspoP50637 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TspoP50637 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TspoP50637 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TspoP50637 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TspoP50637 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TspoP50637 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TspoP50637 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TspoP50637 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TspoP50637 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TspoP50637 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TspoP50637 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TspoP50637 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TspoP50637 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TspoP50637 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TspoP50637 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TspoP50637 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TspoP50637 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TspoP50637 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TspoP50637 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TspoP50637 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TspoP50637 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TspoP50637 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TspoP50637 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TspoP50637 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TspoP50637 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TspoP50637 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TspoP50637 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TspoP50637 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TspoP50637 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TspoP50637 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TspoP50637 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TspoP50637 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TspoP50637 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TspoP50637 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TspoP50637 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TspoP50637 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TspoP50637 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TspoP50637 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TspoP50637 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TspoP50637 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TspoP50637 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TspoP50637 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TspoP50637 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TspoP50637 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TspoP50637 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TspoP50637 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TspoP50637 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TspoP50637 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TspoP50637 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TspoP50637 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TspoP50637 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TspoP50637 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TspoP50637 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TspoP50637 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TspoP50637 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TspoP50637 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TspoP50637 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TspoP50637 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TspoP50637 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TspoP50637 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TspoP50637 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TspoP50637 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TspoP50637 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TspoP50637 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TspoP50637 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TspoP50637 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TspoP50637 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TspoP50637 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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