Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FmodP50608 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FmodP50608 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FmodP50608 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FmodP50608 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FmodP50608 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FmodP50608 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FmodP50608 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FmodP50608 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FmodP50608 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FmodP50608 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FmodP50608 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FmodP50608 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FmodP50608 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FmodP50608 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FmodP50608 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FmodP50608 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FmodP50608 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FmodP50608 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FmodP50608 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FmodP50608 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FmodP50608 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FmodP50608 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FmodP50608 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FmodP50608 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FmodP50608 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FmodP50608 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FmodP50608 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FmodP50608 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FmodP50608 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FmodP50608 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FmodP50608 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FmodP50608 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FmodP50608 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FmodP50608 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
FmodP50608 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FmodP50608 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FmodP50608 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FmodP50608 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FmodP50608 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FmodP50608 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FmodP50608 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FmodP50608 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FmodP50608 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FmodP50608 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FmodP50608 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FmodP50608 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FmodP50608 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FmodP50608 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FmodP50608 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FmodP50608 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FmodP50608 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FmodP50608 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FmodP50608 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FmodP50608 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FmodP50608 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FmodP50608 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FmodP50608 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FmodP50608 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FmodP50608 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FmodP50608 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FmodP50608 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FmodP50608 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FmodP50608 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FmodP50608 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FmodP50608 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FmodP50608 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FmodP50608 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FmodP50608 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FmodP50608 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FmodP50608 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FmodP50608 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FmodP50608 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FmodP50608 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
FmodP50608 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FmodP50608 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FmodP50608 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
FmodP50608 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FmodP50608 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
FmodP50608 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FmodP50608 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FmodP50608 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FmodP50608 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FmodP50608 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FmodP50608 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FmodP50608 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FmodP50608 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.05■□□□□ -0
FmodP50608 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FmodP50608 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FmodP50608 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FmodP50608 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FmodP50608 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FmodP50608 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FmodP50608 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FmodP50608 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FmodP50608 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FmodP50608 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
FmodP50608 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FmodP50608 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FmodP50608 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms