Protein–RNA interactions for Protein: P50580

Pa2g4, Proliferation-associated protein 2G4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pa2g4P50580 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pa2g4P50580 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pa2g4P50580 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pa2g4P50580 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pa2g4P50580 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pa2g4P50580 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pa2g4P50580 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pa2g4P50580 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pa2g4P50580 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pa2g4P50580 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pa2g4P50580 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Pa2g4P50580 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pa2g4P50580 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pa2g4P50580 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pa2g4P50580 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pa2g4P50580 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pa2g4P50580 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pa2g4P50580 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Pa2g4P50580 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Pa2g4P50580 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pa2g4P50580 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pa2g4P50580 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pa2g4P50580 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pa2g4P50580 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Pa2g4P50580 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pa2g4P50580 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pa2g4P50580 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pa2g4P50580 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pa2g4P50580 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pa2g4P50580 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pa2g4P50580 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Pa2g4P50580 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pa2g4P50580 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pa2g4P50580 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pa2g4P50580 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pa2g4P50580 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pa2g4P50580 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pa2g4P50580 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pa2g4P50580 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pa2g4P50580 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pa2g4P50580 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pa2g4P50580 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pa2g4P50580 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pa2g4P50580 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pa2g4P50580 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pa2g4P50580 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pa2g4P50580 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pa2g4P50580 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pa2g4P50580 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pa2g4P50580 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pa2g4P50580 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pa2g4P50580 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pa2g4P50580 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Pa2g4P50580 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pa2g4P50580 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pa2g4P50580 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pa2g4P50580 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pa2g4P50580 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pa2g4P50580 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
Pa2g4P50580 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Pa2g4P50580 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pa2g4P50580 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pa2g4P50580 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pa2g4P50580 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pa2g4P50580 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pa2g4P50580 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pa2g4P50580 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Pa2g4P50580 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pa2g4P50580 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pa2g4P50580 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pa2g4P50580 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pa2g4P50580 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Pa2g4P50580 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pa2g4P50580 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pa2g4P50580 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pa2g4P50580 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pa2g4P50580 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pa2g4P50580 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pa2g4P50580 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pa2g4P50580 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pa2g4P50580 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pa2g4P50580 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pa2g4P50580 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pa2g4P50580 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pa2g4P50580 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pa2g4P50580 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pa2g4P50580 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pa2g4P50580 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pa2g4P50580 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pa2g4P50580 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Pa2g4P50580 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pa2g4P50580 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pa2g4P50580 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Pa2g4P50580 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pa2g4P50580 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pa2g4P50580 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pa2g4P50580 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pa2g4P50580 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pa2g4P50580 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pa2g4P50580 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms