Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LtbrP50284 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LtbrP50284 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LtbrP50284 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
LtbrP50284 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
LtbrP50284 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LtbrP50284 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LtbrP50284 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LtbrP50284 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LtbrP50284 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LtbrP50284 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LtbrP50284 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LtbrP50284 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LtbrP50284 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LtbrP50284 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LtbrP50284 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LtbrP50284 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LtbrP50284 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LtbrP50284 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LtbrP50284 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LtbrP50284 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LtbrP50284 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LtbrP50284 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
LtbrP50284 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LtbrP50284 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LtbrP50284 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LtbrP50284 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LtbrP50284 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LtbrP50284 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
LtbrP50284 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LtbrP50284 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LtbrP50284 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LtbrP50284 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LtbrP50284 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LtbrP50284 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LtbrP50284 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LtbrP50284 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LtbrP50284 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LtbrP50284 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LtbrP50284 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LtbrP50284 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LtbrP50284 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LtbrP50284 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LtbrP50284 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LtbrP50284 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LtbrP50284 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
LtbrP50284 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LtbrP50284 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LtbrP50284 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LtbrP50284 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LtbrP50284 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LtbrP50284 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LtbrP50284 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LtbrP50284 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LtbrP50284 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LtbrP50284 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LtbrP50284 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LtbrP50284 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LtbrP50284 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LtbrP50284 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LtbrP50284 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LtbrP50284 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LtbrP50284 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LtbrP50284 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LtbrP50284 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LtbrP50284 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LtbrP50284 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LtbrP50284 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LtbrP50284 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LtbrP50284 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LtbrP50284 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LtbrP50284 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LtbrP50284 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LtbrP50284 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LtbrP50284 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LtbrP50284 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LtbrP50284 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LtbrP50284 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LtbrP50284 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LtbrP50284 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LtbrP50284 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LtbrP50284 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LtbrP50284 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LtbrP50284 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LtbrP50284 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LtbrP50284 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LtbrP50284 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LtbrP50284 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LtbrP50284 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LtbrP50284 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LtbrP50284 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LtbrP50284 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LtbrP50284 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LtbrP50284 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LtbrP50284 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LtbrP50284 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LtbrP50284 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LtbrP50284 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LtbrP50284 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LtbrP50284 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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