Protein–RNA interactions for Protein: P50228

Cxcl5, C-X-C motif chemokine 5, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl5P50228 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms