Protein–RNA interactions for Protein: P49935

Ctsh, Pro-cathepsin H, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtshP49935 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CtshP49935 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CtshP49935 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CtshP49935 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CtshP49935 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CtshP49935 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CtshP49935 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CtshP49935 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CtshP49935 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CtshP49935 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CtshP49935 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CtshP49935 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CtshP49935 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CtshP49935 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CtshP49935 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CtshP49935 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CtshP49935 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CtshP49935 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CtshP49935 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CtshP49935 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CtshP49935 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CtshP49935 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CtshP49935 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CtshP49935 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CtshP49935 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CtshP49935 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CtshP49935 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CtshP49935 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CtshP49935 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CtshP49935 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CtshP49935 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CtshP49935 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CtshP49935 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CtshP49935 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CtshP49935 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CtshP49935 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CtshP49935 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CtshP49935 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CtshP49935 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CtshP49935 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CtshP49935 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CtshP49935 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CtshP49935 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CtshP49935 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CtshP49935 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CtshP49935 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CtshP49935 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CtshP49935 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CtshP49935 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CtshP49935 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CtshP49935 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CtshP49935 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CtshP49935 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CtshP49935 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CtshP49935 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CtshP49935 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CtshP49935 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CtshP49935 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CtshP49935 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CtshP49935 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CtshP49935 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CtshP49935 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CtshP49935 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CtshP49935 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CtshP49935 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CtshP49935 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CtshP49935 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CtshP49935 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CtshP49935 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CtshP49935 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CtshP49935 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CtshP49935 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CtshP49935 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CtshP49935 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CtshP49935 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CtshP49935 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CtshP49935 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CtshP49935 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CtshP49935 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CtshP49935 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CtshP49935 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CtshP49935 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CtshP49935 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CtshP49935 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CtshP49935 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CtshP49935 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CtshP49935 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CtshP49935 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CtshP49935 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CtshP49935 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CtshP49935 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CtshP49935 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CtshP49935 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CtshP49935 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CtshP49935 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CtshP49935 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CtshP49935 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CtshP49935 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CtshP49935 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CtshP49935 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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