Protein–RNA interactions for Protein: P49615

Cdk5, Cyclin-dependent-like kinase 5, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5P49615 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdk5P49615 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdk5P49615 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdk5P49615 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdk5P49615 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdk5P49615 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdk5P49615 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdk5P49615 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdk5P49615 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdk5P49615 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdk5P49615 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdk5P49615 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdk5P49615 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdk5P49615 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdk5P49615 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdk5P49615 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdk5P49615 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdk5P49615 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdk5P49615 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdk5P49615 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdk5P49615 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdk5P49615 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdk5P49615 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdk5P49615 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdk5P49615 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdk5P49615 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdk5P49615 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdk5P49615 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdk5P49615 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdk5P49615 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdk5P49615 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdk5P49615 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdk5P49615 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdk5P49615 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdk5P49615 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdk5P49615 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdk5P49615 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdk5P49615 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdk5P49615 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdk5P49615 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdk5P49615 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdk5P49615 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdk5P49615 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdk5P49615 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdk5P49615 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdk5P49615 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdk5P49615 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdk5P49615 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdk5P49615 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdk5P49615 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdk5P49615 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cdk5P49615 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cdk5P49615 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cdk5P49615 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cdk5P49615 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cdk5P49615 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cdk5P49615 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cdk5P49615 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cdk5P49615 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdk5P49615 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdk5P49615 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdk5P49615 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdk5P49615 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdk5P49615 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdk5P49615 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdk5P49615 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdk5P49615 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdk5P49615 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdk5P49615 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdk5P49615 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdk5P49615 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdk5P49615 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdk5P49615 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdk5P49615 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdk5P49615 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdk5P49615 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdk5P49615 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdk5P49615 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdk5P49615 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdk5P49615 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdk5P49615 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdk5P49615 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdk5P49615 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdk5P49615 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdk5P49615 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdk5P49615 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdk5P49615 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdk5P49615 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdk5P49615 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdk5P49615 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdk5P49615 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdk5P49615 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdk5P49615 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdk5P49615 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdk5P49615 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdk5P49615 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdk5P49615 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdk5P49615 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdk5P49615 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdk5P49615 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms