Protein–RNA interactions for Protein: P49135

Ercc3, General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc3P49135 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ercc3P49135 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ercc3P49135 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ercc3P49135 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ercc3P49135 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ercc3P49135 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ercc3P49135 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ercc3P49135 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ercc3P49135 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ercc3P49135 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ercc3P49135 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ercc3P49135 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ercc3P49135 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ercc3P49135 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ercc3P49135 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ercc3P49135 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ercc3P49135 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ercc3P49135 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ercc3P49135 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ercc3P49135 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ercc3P49135 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ercc3P49135 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ercc3P49135 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ercc3P49135 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ercc3P49135 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ercc3P49135 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ercc3P49135 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ercc3P49135 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ercc3P49135 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ercc3P49135 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ercc3P49135 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ercc3P49135 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ercc3P49135 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ercc3P49135 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ercc3P49135 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ercc3P49135 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ercc3P49135 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ercc3P49135 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ercc3P49135 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ercc3P49135 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ercc3P49135 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ercc3P49135 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ercc3P49135 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ercc3P49135 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ercc3P49135 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ercc3P49135 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ercc3P49135 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ercc3P49135 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ercc3P49135 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ercc3P49135 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ercc3P49135 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ercc3P49135 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ercc3P49135 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ercc3P49135 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Ercc3P49135 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ercc3P49135 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ercc3P49135 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ercc3P49135 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ercc3P49135 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ercc3P49135 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ercc3P49135 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ercc3P49135 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ercc3P49135 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ercc3P49135 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ercc3P49135 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ercc3P49135 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ercc3P49135 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ercc3P49135 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ercc3P49135 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ercc3P49135 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ercc3P49135 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ercc3P49135 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ercc3P49135 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ercc3P49135 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ercc3P49135 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ercc3P49135 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ercc3P49135 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ercc3P49135 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ercc3P49135 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ercc3P49135 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ercc3P49135 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ercc3P49135 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ercc3P49135 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ercc3P49135 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ercc3P49135 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ercc3P49135 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ercc3P49135 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ercc3P49135 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ercc3P49135 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ercc3P49135 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ercc3P49135 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ercc3P49135 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ercc3P49135 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ercc3P49135 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ercc3P49135 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ercc3P49135 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ercc3P49135 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ercc3P49135 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ercc3P49135 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ercc3P49135 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms