Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbx2P48031 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbx2P48031 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbx2P48031 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbx2P48031 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbx2P48031 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbx2P48031 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbx2P48031 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbx2P48031 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbx2P48031 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbx2P48031 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbx2P48031 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbx2P48031 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbx2P48031 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbx2P48031 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbx2P48031 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbx2P48031 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbx2P48031 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbx2P48031 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbx2P48031 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbx2P48031 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbx2P48031 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbx2P48031 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbx2P48031 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbx2P48031 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbx2P48031 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbx2P48031 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbx2P48031 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbx2P48031 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbx2P48031 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbx2P48031 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbx2P48031 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbx2P48031 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbx2P48031 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbx2P48031 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbx2P48031 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbx2P48031 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbx2P48031 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbx2P48031 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbx2P48031 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbx2P48031 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbx2P48031 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbx2P48031 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbx2P48031 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbx2P48031 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbx2P48031 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbx2P48031 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbx2P48031 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbx2P48031 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbx2P48031 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbx2P48031 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbx2P48031 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbx2P48031 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbx2P48031 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbx2P48031 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbx2P48031 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbx2P48031 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbx2P48031 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbx2P48031 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbx2P48031 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbx2P48031 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbx2P48031 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbx2P48031 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbx2P48031 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbx2P48031 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbx2P48031 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbx2P48031 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbx2P48031 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbx2P48031 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbx2P48031 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbx2P48031 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbx2P48031 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbx2P48031 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gbx2P48031 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gbx2P48031 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gbx2P48031 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gbx2P48031 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gbx2P48031 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gbx2P48031 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gbx2P48031 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gbx2P48031 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gbx2P48031 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gbx2P48031 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gbx2P48031 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gbx2P48031 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gbx2P48031 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gbx2P48031 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gbx2P48031 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gbx2P48031 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gbx2P48031 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gbx2P48031 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gbx2P48031 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gbx2P48031 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gbx2P48031 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gbx2P48031 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gbx2P48031 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gbx2P48031 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gbx2P48031 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gbx2P48031 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gbx2P48031 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms