Protein–RNA interactions for Protein: P47880

Igfbp6, Insulin-like growth factor-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igfbp6P47880 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Igfbp6P47880 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Igfbp6P47880 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Igfbp6P47880 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Igfbp6P47880 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Igfbp6P47880 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Igfbp6P47880 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Igfbp6P47880 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Igfbp6P47880 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Igfbp6P47880 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Igfbp6P47880 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Igfbp6P47880 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Igfbp6P47880 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Igfbp6P47880 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Igfbp6P47880 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Igfbp6P47880 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Igfbp6P47880 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Igfbp6P47880 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Igfbp6P47880 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Igfbp6P47880 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Igfbp6P47880 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Igfbp6P47880 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Igfbp6P47880 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Igfbp6P47880 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Igfbp6P47880 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Igfbp6P47880 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Igfbp6P47880 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Igfbp6P47880 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Igfbp6P47880 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Igfbp6P47880 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Igfbp6P47880 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Igfbp6P47880 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Igfbp6P47880 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Igfbp6P47880 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Igfbp6P47880 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Igfbp6P47880 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Igfbp6P47880 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Igfbp6P47880 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Igfbp6P47880 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Igfbp6P47880 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Igfbp6P47880 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Igfbp6P47880 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Igfbp6P47880 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Igfbp6P47880 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Igfbp6P47880 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Igfbp6P47880 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Igfbp6P47880 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Igfbp6P47880 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Igfbp6P47880 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Igfbp6P47880 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Igfbp6P47880 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Igfbp6P47880 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Igfbp6P47880 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Igfbp6P47880 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Igfbp6P47880 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Igfbp6P47880 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Igfbp6P47880 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Igfbp6P47880 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Igfbp6P47880 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Igfbp6P47880 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Igfbp6P47880 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Igfbp6P47880 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Igfbp6P47880 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Igfbp6P47880 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Igfbp6P47880 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Igfbp6P47880 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Igfbp6P47880 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Igfbp6P47880 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Igfbp6P47880 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Igfbp6P47880 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Igfbp6P47880 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Igfbp6P47880 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Igfbp6P47880 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Igfbp6P47880 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Igfbp6P47880 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Igfbp6P47880 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Igfbp6P47880 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Igfbp6P47880 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Igfbp6P47880 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Igfbp6P47880 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Igfbp6P47880 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Igfbp6P47880 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Igfbp6P47880 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Igfbp6P47880 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Igfbp6P47880 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Igfbp6P47880 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Igfbp6P47880 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Igfbp6P47880 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Igfbp6P47880 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Igfbp6P47880 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Igfbp6P47880 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Igfbp6P47880 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Igfbp6P47880 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Igfbp6P47880 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Igfbp6P47880 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Igfbp6P47880 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Igfbp6P47880 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Igfbp6P47880 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Igfbp6P47880 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Igfbp6P47880 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms