Protein–RNA interactions for Protein: P43024

Cox6a1, Cytochrome c oxidase subunit 6A1, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox6a1P43024 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cox6a1P43024 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cox6a1P43024 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cox6a1P43024 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cox6a1P43024 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cox6a1P43024 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cox6a1P43024 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cox6a1P43024 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cox6a1P43024 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cox6a1P43024 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cox6a1P43024 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cox6a1P43024 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cox6a1P43024 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cox6a1P43024 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cox6a1P43024 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cox6a1P43024 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cox6a1P43024 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cox6a1P43024 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cox6a1P43024 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cox6a1P43024 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cox6a1P43024 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cox6a1P43024 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cox6a1P43024 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cox6a1P43024 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cox6a1P43024 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cox6a1P43024 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cox6a1P43024 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cox6a1P43024 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cox6a1P43024 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cox6a1P43024 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cox6a1P43024 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cox6a1P43024 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cox6a1P43024 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cox6a1P43024 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cox6a1P43024 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cox6a1P43024 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cox6a1P43024 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cox6a1P43024 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cox6a1P43024 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cox6a1P43024 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cox6a1P43024 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cox6a1P43024 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cox6a1P43024 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cox6a1P43024 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cox6a1P43024 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cox6a1P43024 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cox6a1P43024 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cox6a1P43024 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cox6a1P43024 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cox6a1P43024 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cox6a1P43024 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cox6a1P43024 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cox6a1P43024 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cox6a1P43024 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cox6a1P43024 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cox6a1P43024 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cox6a1P43024 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cox6a1P43024 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cox6a1P43024 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cox6a1P43024 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cox6a1P43024 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cox6a1P43024 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cox6a1P43024 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cox6a1P43024 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cox6a1P43024 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cox6a1P43024 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cox6a1P43024 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cox6a1P43024 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cox6a1P43024 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cox6a1P43024 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cox6a1P43024 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cox6a1P43024 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cox6a1P43024 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cox6a1P43024 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cox6a1P43024 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cox6a1P43024 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cox6a1P43024 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cox6a1P43024 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cox6a1P43024 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cox6a1P43024 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cox6a1P43024 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cox6a1P43024 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cox6a1P43024 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cox6a1P43024 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cox6a1P43024 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cox6a1P43024 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cox6a1P43024 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cox6a1P43024 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cox6a1P43024 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cox6a1P43024 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cox6a1P43024 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cox6a1P43024 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cox6a1P43024 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cox6a1P43024 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cox6a1P43024 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cox6a1P43024 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cox6a1P43024 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cox6a1P43024 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cox6a1P43024 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cox6a1P43024 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms