Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nkx1-2P42580 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nkx1-2P42580 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nkx1-2P42580 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nkx1-2P42580 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nkx1-2P42580 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nkx1-2P42580 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Nkx1-2P42580 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nkx1-2P42580 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nkx1-2P42580 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nkx1-2P42580 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nkx1-2P42580 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nkx1-2P42580 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nkx1-2P42580 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nkx1-2P42580 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nkx1-2P42580 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Nkx1-2P42580 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nkx1-2P42580 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nkx1-2P42580 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nkx1-2P42580 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nkx1-2P42580 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Nkx1-2P42580 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nkx1-2P42580 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nkx1-2P42580 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nkx1-2P42580 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nkx1-2P42580 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nkx1-2P42580 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nkx1-2P42580 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nkx1-2P42580 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nkx1-2P42580 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nkx1-2P42580 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nkx1-2P42580 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nkx1-2P42580 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nkx1-2P42580 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nkx1-2P42580 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nkx1-2P42580 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Nkx1-2P42580 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nkx1-2P42580 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nkx1-2P42580 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nkx1-2P42580 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nkx1-2P42580 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nkx1-2P42580 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nkx1-2P42580 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nkx1-2P42580 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nkx1-2P42580 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nkx1-2P42580 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nkx1-2P42580 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nkx1-2P42580 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nkx1-2P42580 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nkx1-2P42580 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nkx1-2P42580 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nkx1-2P42580 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nkx1-2P42580 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nkx1-2P42580 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nkx1-2P42580 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nkx1-2P42580 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nkx1-2P42580 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nkx1-2P42580 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nkx1-2P42580 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nkx1-2P42580 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nkx1-2P42580 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nkx1-2P42580 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nkx1-2P42580 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Nkx1-2P42580 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nkx1-2P42580 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nkx1-2P42580 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nkx1-2P42580 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Nkx1-2P42580 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nkx1-2P42580 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nkx1-2P42580 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nkx1-2P42580 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nkx1-2P42580 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nkx1-2P42580 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nkx1-2P42580 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nkx1-2P42580 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nkx1-2P42580 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nkx1-2P42580 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nkx1-2P42580 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nkx1-2P42580 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nkx1-2P42580 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nkx1-2P42580 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Nkx1-2P42580 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nkx1-2P42580 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nkx1-2P42580 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nkx1-2P42580 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nkx1-2P42580 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nkx1-2P42580 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nkx1-2P42580 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nkx1-2P42580 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nkx1-2P42580 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nkx1-2P42580 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nkx1-2P42580 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nkx1-2P42580 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nkx1-2P42580 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nkx1-2P42580 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nkx1-2P42580 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nkx1-2P42580 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nkx1-2P42580 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nkx1-2P42580 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nkx1-2P42580 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.8 ms