Protein–RNA interactions for Protein: P42209

Sept1, Septin-1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept1P42209 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sept1P42209 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Sept1P42209 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sept1P42209 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sept1P42209 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sept1P42209 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sept1P42209 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sept1P42209 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sept1P42209 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sept1P42209 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sept1P42209 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sept1P42209 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sept1P42209 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sept1P42209 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sept1P42209 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sept1P42209 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sept1P42209 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sept1P42209 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sept1P42209 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sept1P42209 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sept1P42209 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sept1P42209 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sept1P42209 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sept1P42209 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sept1P42209 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sept1P42209 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sept1P42209 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sept1P42209 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sept1P42209 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sept1P42209 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sept1P42209 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sept1P42209 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sept1P42209 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sept1P42209 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sept1P42209 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sept1P42209 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sept1P42209 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sept1P42209 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sept1P42209 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sept1P42209 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sept1P42209 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sept1P42209 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sept1P42209 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sept1P42209 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sept1P42209 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Sept1P42209 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Sept1P42209 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sept1P42209 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sept1P42209 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sept1P42209 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sept1P42209 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sept1P42209 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sept1P42209 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sept1P42209 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Sept1P42209 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sept1P42209 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sept1P42209 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Sept1P42209 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sept1P42209 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sept1P42209 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sept1P42209 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sept1P42209 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sept1P42209 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sept1P42209 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sept1P42209 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sept1P42209 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sept1P42209 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sept1P42209 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sept1P42209 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sept1P42209 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sept1P42209 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Sept1P42209 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Sept1P42209 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sept1P42209 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Sept1P42209 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Sept1P42209 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sept1P42209 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sept1P42209 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sept1P42209 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sept1P42209 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sept1P42209 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sept1P42209 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sept1P42209 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Sept1P42209 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sept1P42209 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sept1P42209 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sept1P42209 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sept1P42209 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sept1P42209 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sept1P42209 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sept1P42209 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sept1P42209 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sept1P42209 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sept1P42209 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sept1P42209 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sept1P42209 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sept1P42209 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sept1P42209 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sept1P42209 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sept1P42209 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms