Protein–RNA interactions for Protein: P41438

Slc19a1, Folate transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc19a1P41438 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc19a1P41438 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc19a1P41438 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc19a1P41438 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc19a1P41438 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc19a1P41438 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc19a1P41438 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc19a1P41438 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc19a1P41438 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc19a1P41438 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc19a1P41438 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc19a1P41438 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc19a1P41438 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc19a1P41438 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc19a1P41438 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc19a1P41438 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc19a1P41438 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc19a1P41438 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc19a1P41438 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc19a1P41438 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc19a1P41438 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc19a1P41438 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc19a1P41438 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc19a1P41438 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc19a1P41438 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc19a1P41438 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc19a1P41438 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc19a1P41438 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc19a1P41438 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc19a1P41438 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc19a1P41438 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc19a1P41438 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc19a1P41438 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc19a1P41438 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc19a1P41438 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc19a1P41438 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc19a1P41438 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc19a1P41438 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc19a1P41438 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc19a1P41438 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc19a1P41438 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc19a1P41438 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc19a1P41438 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc19a1P41438 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc19a1P41438 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc19a1P41438 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc19a1P41438 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc19a1P41438 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc19a1P41438 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Slc19a1P41438 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Slc19a1P41438 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc19a1P41438 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc19a1P41438 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc19a1P41438 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc19a1P41438 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc19a1P41438 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc19a1P41438 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc19a1P41438 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc19a1P41438 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc19a1P41438 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc19a1P41438 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc19a1P41438 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc19a1P41438 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc19a1P41438 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc19a1P41438 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc19a1P41438 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc19a1P41438 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc19a1P41438 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc19a1P41438 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc19a1P41438 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc19a1P41438 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc19a1P41438 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc19a1P41438 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc19a1P41438 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc19a1P41438 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc19a1P41438 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc19a1P41438 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc19a1P41438 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc19a1P41438 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc19a1P41438 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc19a1P41438 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc19a1P41438 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc19a1P41438 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc19a1P41438 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc19a1P41438 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc19a1P41438 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc19a1P41438 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc19a1P41438 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc19a1P41438 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc19a1P41438 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc19a1P41438 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc19a1P41438 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc19a1P41438 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc19a1P41438 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc19a1P41438 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc19a1P41438 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc19a1P41438 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc19a1P41438 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc19a1P41438 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc19a1P41438 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms