Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LtbP41155 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LtbP41155 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LtbP41155 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LtbP41155 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LtbP41155 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LtbP41155 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LtbP41155 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LtbP41155 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LtbP41155 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LtbP41155 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LtbP41155 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LtbP41155 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LtbP41155 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LtbP41155 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LtbP41155 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LtbP41155 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LtbP41155 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LtbP41155 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LtbP41155 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LtbP41155 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LtbP41155 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LtbP41155 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LtbP41155 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LtbP41155 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LtbP41155 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LtbP41155 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LtbP41155 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LtbP41155 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LtbP41155 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LtbP41155 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LtbP41155 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LtbP41155 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LtbP41155 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LtbP41155 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LtbP41155 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LtbP41155 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LtbP41155 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LtbP41155 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LtbP41155 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LtbP41155 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LtbP41155 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LtbP41155 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LtbP41155 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LtbP41155 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LtbP41155 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LtbP41155 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LtbP41155 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LtbP41155 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LtbP41155 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LtbP41155 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LtbP41155 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LtbP41155 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LtbP41155 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LtbP41155 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LtbP41155 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LtbP41155 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LtbP41155 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LtbP41155 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LtbP41155 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LtbP41155 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LtbP41155 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LtbP41155 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LtbP41155 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LtbP41155 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LtbP41155 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LtbP41155 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LtbP41155 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LtbP41155 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LtbP41155 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LtbP41155 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LtbP41155 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LtbP41155 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LtbP41155 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LtbP41155 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LtbP41155 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LtbP41155 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LtbP41155 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LtbP41155 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LtbP41155 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LtbP41155 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LtbP41155 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LtbP41155 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LtbP41155 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LtbP41155 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LtbP41155 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LtbP41155 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LtbP41155 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LtbP41155 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LtbP41155 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LtbP41155 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LtbP41155 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LtbP41155 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LtbP41155 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LtbP41155 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LtbP41155 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LtbP41155 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LtbP41155 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LtbP41155 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LtbP41155 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms