Protein–RNA interactions for Protein: P40749

Syt4, Synaptotagmin-4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt4P40749 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syt4P40749 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syt4P40749 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syt4P40749 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syt4P40749 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Syt4P40749 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syt4P40749 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Syt4P40749 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Syt4P40749 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Syt4P40749 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Syt4P40749 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syt4P40749 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syt4P40749 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syt4P40749 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syt4P40749 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syt4P40749 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syt4P40749 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syt4P40749 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syt4P40749 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syt4P40749 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syt4P40749 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syt4P40749 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syt4P40749 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syt4P40749 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syt4P40749 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Syt4P40749 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syt4P40749 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syt4P40749 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syt4P40749 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syt4P40749 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syt4P40749 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syt4P40749 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syt4P40749 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syt4P40749 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syt4P40749 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syt4P40749 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syt4P40749 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syt4P40749 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syt4P40749 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syt4P40749 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syt4P40749 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syt4P40749 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syt4P40749 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syt4P40749 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syt4P40749 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syt4P40749 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syt4P40749 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syt4P40749 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syt4P40749 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syt4P40749 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syt4P40749 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syt4P40749 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syt4P40749 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syt4P40749 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syt4P40749 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syt4P40749 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syt4P40749 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syt4P40749 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syt4P40749 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syt4P40749 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syt4P40749 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syt4P40749 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syt4P40749 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syt4P40749 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syt4P40749 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syt4P40749 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syt4P40749 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syt4P40749 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syt4P40749 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syt4P40749 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syt4P40749 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syt4P40749 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syt4P40749 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syt4P40749 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syt4P40749 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syt4P40749 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syt4P40749 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syt4P40749 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Syt4P40749 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syt4P40749 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syt4P40749 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syt4P40749 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syt4P40749 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syt4P40749 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syt4P40749 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syt4P40749 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syt4P40749 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syt4P40749 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syt4P40749 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syt4P40749 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syt4P40749 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syt4P40749 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syt4P40749 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syt4P40749 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syt4P40749 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syt4P40749 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syt4P40749 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syt4P40749 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syt4P40749 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syt4P40749 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms