Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VhlP40338 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VhlP40338 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VhlP40338 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VhlP40338 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VhlP40338 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VhlP40338 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VhlP40338 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VhlP40338 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VhlP40338 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VhlP40338 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VhlP40338 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VhlP40338 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VhlP40338 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VhlP40338 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VhlP40338 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VhlP40338 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VhlP40338 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VhlP40338 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VhlP40338 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VhlP40338 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VhlP40338 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VhlP40338 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VhlP40338 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
VhlP40338 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VhlP40338 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VhlP40338 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VhlP40338 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VhlP40338 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VhlP40338 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VhlP40338 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VhlP40338 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VhlP40338 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VhlP40338 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VhlP40338 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VhlP40338 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VhlP40338 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VhlP40338 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VhlP40338 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VhlP40338 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VhlP40338 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VhlP40338 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VhlP40338 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VhlP40338 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VhlP40338 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VhlP40338 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VhlP40338 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VhlP40338 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VhlP40338 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VhlP40338 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VhlP40338 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VhlP40338 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VhlP40338 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VhlP40338 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VhlP40338 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VhlP40338 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VhlP40338 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VhlP40338 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VhlP40338 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VhlP40338 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VhlP40338 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VhlP40338 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VhlP40338 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VhlP40338 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VhlP40338 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VhlP40338 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VhlP40338 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VhlP40338 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VhlP40338 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VhlP40338 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VhlP40338 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VhlP40338 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VhlP40338 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VhlP40338 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VhlP40338 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VhlP40338 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VhlP40338 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
VhlP40338 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VhlP40338 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VhlP40338 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
VhlP40338 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VhlP40338 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VhlP40338 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VhlP40338 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VhlP40338 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VhlP40338 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
VhlP40338 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VhlP40338 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VhlP40338 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VhlP40338 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VhlP40338 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
VhlP40338 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
VhlP40338 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VhlP40338 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VhlP40338 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VhlP40338 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VhlP40338 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VhlP40338 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VhlP40338 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VhlP40338 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms