Protein–RNA interactions for Protein: P40223

Csf3r, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3rP40223 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csf3rP40223 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csf3rP40223 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csf3rP40223 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csf3rP40223 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csf3rP40223 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csf3rP40223 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csf3rP40223 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csf3rP40223 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csf3rP40223 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csf3rP40223 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csf3rP40223 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csf3rP40223 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Csf3rP40223 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Csf3rP40223 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Csf3rP40223 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Csf3rP40223 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Csf3rP40223 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Csf3rP40223 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Csf3rP40223 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Csf3rP40223 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Csf3rP40223 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Csf3rP40223 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Csf3rP40223 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Csf3rP40223 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Csf3rP40223 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Csf3rP40223 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Csf3rP40223 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csf3rP40223 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csf3rP40223 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csf3rP40223 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csf3rP40223 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csf3rP40223 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csf3rP40223 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csf3rP40223 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Csf3rP40223 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csf3rP40223 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csf3rP40223 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csf3rP40223 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csf3rP40223 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csf3rP40223 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csf3rP40223 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csf3rP40223 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csf3rP40223 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csf3rP40223 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csf3rP40223 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csf3rP40223 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csf3rP40223 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csf3rP40223 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csf3rP40223 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csf3rP40223 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csf3rP40223 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csf3rP40223 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csf3rP40223 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csf3rP40223 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csf3rP40223 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csf3rP40223 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csf3rP40223 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csf3rP40223 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csf3rP40223 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csf3rP40223 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csf3rP40223 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csf3rP40223 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csf3rP40223 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csf3rP40223 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csf3rP40223 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Csf3rP40223 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csf3rP40223 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Csf3rP40223 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csf3rP40223 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csf3rP40223 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csf3rP40223 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csf3rP40223 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csf3rP40223 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csf3rP40223 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csf3rP40223 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csf3rP40223 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csf3rP40223 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csf3rP40223 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csf3rP40223 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csf3rP40223 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csf3rP40223 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csf3rP40223 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csf3rP40223 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csf3rP40223 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csf3rP40223 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csf3rP40223 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csf3rP40223 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csf3rP40223 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csf3rP40223 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csf3rP40223 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csf3rP40223 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csf3rP40223 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csf3rP40223 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Csf3rP40223 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Csf3rP40223 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Csf3rP40223 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Csf3rP40223 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Csf3rP40223 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Csf3rP40223 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms