Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grik2P39087 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grik2P39087 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grik2P39087 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grik2P39087 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grik2P39087 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grik2P39087 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grik2P39087 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Grik2P39087 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Grik2P39087 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Grik2P39087 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Grik2P39087 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Grik2P39087 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Grik2P39087 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Grik2P39087 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Grik2P39087 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Grik2P39087 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Grik2P39087 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Grik2P39087 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Grik2P39087 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Grik2P39087 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Grik2P39087 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Grik2P39087 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grik2P39087 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grik2P39087 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grik2P39087 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grik2P39087 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grik2P39087 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grik2P39087 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grik2P39087 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grik2P39087 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grik2P39087 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Grik2P39087 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grik2P39087 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Grik2P39087 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grik2P39087 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grik2P39087 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grik2P39087 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grik2P39087 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grik2P39087 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grik2P39087 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grik2P39087 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grik2P39087 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grik2P39087 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grik2P39087 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grik2P39087 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grik2P39087 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grik2P39087 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grik2P39087 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Grik2P39087 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grik2P39087 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grik2P39087 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grik2P39087 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grik2P39087 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grik2P39087 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grik2P39087 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grik2P39087 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grik2P39087 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grik2P39087 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grik2P39087 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Grik2P39087 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grik2P39087 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grik2P39087 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grik2P39087 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grik2P39087 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grik2P39087 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Grik2P39087 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grik2P39087 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grik2P39087 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grik2P39087 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grik2P39087 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grik2P39087 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grik2P39087 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grik2P39087 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grik2P39087 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grik2P39087 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Grik2P39087 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grik2P39087 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grik2P39087 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grik2P39087 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grik2P39087 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grik2P39087 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grik2P39087 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grik2P39087 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grik2P39087 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grik2P39087 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grik2P39087 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grik2P39087 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grik2P39087 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grik2P39087 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grik2P39087 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grik2P39087 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Grik2P39087 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grik2P39087 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grik2P39087 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grik2P39087 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grik2P39087 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Grik2P39087 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grik2P39087 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grik2P39087 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms