Protein–RNA interactions for Protein: P39061

Col18a1, Collagen alpha-1(XVIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col18a1P39061 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Col18a1P39061 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Col18a1P39061 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Col18a1P39061 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Col18a1P39061 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Col18a1P39061 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Col18a1P39061 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Col18a1P39061 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Col18a1P39061 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Col18a1P39061 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Col18a1P39061 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Col18a1P39061 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Col18a1P39061 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Col18a1P39061 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Col18a1P39061 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Col18a1P39061 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Col18a1P39061 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Col18a1P39061 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Col18a1P39061 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Col18a1P39061 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Col18a1P39061 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Col18a1P39061 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Col18a1P39061 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Col18a1P39061 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Col18a1P39061 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Col18a1P39061 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Col18a1P39061 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Col18a1P39061 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Col18a1P39061 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Col18a1P39061 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Col18a1P39061 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Col18a1P39061 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Col18a1P39061 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Col18a1P39061 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Col18a1P39061 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Col18a1P39061 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Col18a1P39061 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Col18a1P39061 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Col18a1P39061 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Col18a1P39061 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Col18a1P39061 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Col18a1P39061 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Col18a1P39061 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Col18a1P39061 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Col18a1P39061 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Col18a1P39061 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Col18a1P39061 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Col18a1P39061 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Col18a1P39061 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Col18a1P39061 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Col18a1P39061 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Col18a1P39061 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Col18a1P39061 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Col18a1P39061 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Col18a1P39061 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Col18a1P39061 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Col18a1P39061 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Col18a1P39061 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Col18a1P39061 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Col18a1P39061 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Col18a1P39061 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Col18a1P39061 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Col18a1P39061 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Col18a1P39061 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Col18a1P39061 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Col18a1P39061 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Col18a1P39061 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Col18a1P39061 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Col18a1P39061 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Col18a1P39061 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Col18a1P39061 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Col18a1P39061 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Col18a1P39061 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Col18a1P39061 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Col18a1P39061 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Col18a1P39061 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Col18a1P39061 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Col18a1P39061 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Col18a1P39061 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Col18a1P39061 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Col18a1P39061 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Col18a1P39061 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Col18a1P39061 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Col18a1P39061 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Col18a1P39061 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Col18a1P39061 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Col18a1P39061 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Col18a1P39061 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Col18a1P39061 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Col18a1P39061 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Col18a1P39061 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Col18a1P39061 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Col18a1P39061 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Col18a1P39061 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Col18a1P39061 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Col18a1P39061 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Col18a1P39061 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Col18a1P39061 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Col18a1P39061 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Col18a1P39061 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms