Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lig1P37913 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Lig1P37913 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lig1P37913 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lig1P37913 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lig1P37913 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lig1P37913 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lig1P37913 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lig1P37913 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lig1P37913 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lig1P37913 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lig1P37913 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lig1P37913 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lig1P37913 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lig1P37913 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lig1P37913 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Lig1P37913 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lig1P37913 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lig1P37913 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Lig1P37913 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lig1P37913 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lig1P37913 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lig1P37913 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lig1P37913 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lig1P37913 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lig1P37913 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lig1P37913 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lig1P37913 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lig1P37913 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lig1P37913 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lig1P37913 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lig1P37913 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lig1P37913 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lig1P37913 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lig1P37913 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lig1P37913 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lig1P37913 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lig1P37913 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Lig1P37913 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lig1P37913 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lig1P37913 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lig1P37913 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lig1P37913 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lig1P37913 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lig1P37913 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lig1P37913 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lig1P37913 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lig1P37913 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lig1P37913 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Lig1P37913 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lig1P37913 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lig1P37913 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lig1P37913 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lig1P37913 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lig1P37913 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lig1P37913 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lig1P37913 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lig1P37913 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lig1P37913 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lig1P37913 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lig1P37913 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lig1P37913 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lig1P37913 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lig1P37913 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lig1P37913 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lig1P37913 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lig1P37913 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lig1P37913 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lig1P37913 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Lig1P37913 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lig1P37913 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lig1P37913 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lig1P37913 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Lig1P37913 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Lig1P37913 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lig1P37913 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lig1P37913 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lig1P37913 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lig1P37913 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lig1P37913 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lig1P37913 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lig1P37913 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lig1P37913 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lig1P37913 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lig1P37913 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lig1P37913 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lig1P37913 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lig1P37913 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lig1P37913 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Lig1P37913 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lig1P37913 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lig1P37913 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lig1P37913 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lig1P37913 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lig1P37913 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Lig1P37913 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lig1P37913 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Lig1P37913 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Lig1P37913 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lig1P37913 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms